193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0770 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02754  arginine exporter protein  100 
 
 		 211 aa  420  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0770  L-lysine exporter  100 
 
 		 211 aa  420  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0787  arginine exporter protein  100 
 
 		 211 aa  420  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02717  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  420  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3081  arginine exporter protein  100 
 
 		 211 aa  420  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  98.1 
 
 		 211 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  98.1 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  98.1 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  98.1 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  91.47 
 
 		 211 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  91 
 
 		 211 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  91 
 
 		 211 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3336  arginine exporter protein  88.63 
 
 		 211 aa  367  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.313713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3305  arginine exporter protein  90.52 
 
 		 211 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.66 
 
 		 204 aa  290  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  73.27 
 
 		 205 aa  280  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3686  arginine exporter protein  76.24 
 
 		 204 aa  271  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3883  arginine exporter protein  76.73 
 
 		 204 aa  270  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  67.82 
 
 		 205 aa  267  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3819  arginine exporter protein  68.32 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.771227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0852  arginine exporter protein  68.32 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0116033  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002476  lysine efflux permease  48.47 
 
 		 209 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03559  hypothetical protein  48.69 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0033  LysE family protein  44.39 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  46.27 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  44.78 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1472  lysine exporter protein LysE/YggA  48.7 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  40.8 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  43.22 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.18 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.5 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  43.22 
 
 		 199 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  42.71 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1011  lysine exporter protein LysE/YggA  42.33 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.591739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  41.92 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  41.92 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  41.92 
 
 		 199 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  42.56 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  42.21 
 
 		 208 aa  148  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4136  amino acid transporter LysE  41.27 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.540891  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.1 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 205 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  37.37 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.31 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  40.62 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  40.82 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  39.8 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  39.29 
 
 		 204 aa  141  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  39.29 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  39.29 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  45.45 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 200 aa  138  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  40.31 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  44.95 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.07 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  43.65 
 
 		 204 aa  134  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  38.78 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  38.78 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  38.78 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  38.78 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  37.76 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  39.5 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  39.6 
 
 		 204 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1903  lysine exporter protein LysE/YggA  41.92 
 
 		 199 aa  131  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  38.27 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  38.78 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  41.71 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  40.93 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.29 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  35.08 
 
 		 202 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2011  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.27 
 
 		 213 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.53 
 
 		 207 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0033  LysE family protein  37.76 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2963  basic amino acid exporter LysE  38 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1338  lysine exporter protein LysE/YggA  40.89 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  37.11 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3475  L-lysine exporter, putative  40 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0029  LysE family protein  37.76 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1182  LysE family protein  37.76 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1462  LysE family protein  37.76 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0049  LysE family protein  37.76 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0035  LysE family translocator protein  37.76 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0035  LysE family protein  37.76 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.780183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1114  lysine exporter protein LysE/YggA  49.19 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1537  LysE family protein  37.76 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  36.92 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2966  hypothetical protein  35.57 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2816  hypothetical protein  35.05 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26510  Lysine exporter protein  38.16 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  40.1 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  35.05 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  36.08 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3862  putative transporter  39.09 
 
 		 216 aa  121  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00177  arginine exporter protein  37 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  37.63 
 
 		 202 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.9 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>