221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00177 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00177  arginine exporter protein  100 
 
 		 200 aa  393  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3529  lysine exporter protein LysE/YggA  50 
 
 		 202 aa  181  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0248558  normal  0.180105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2593  lysine exporter protein LysE/YggA  39.46 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2670  lysine exporter protein LysE/YggA  39.46 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000865788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  39.46 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000168732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1789  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.46 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000102829  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1699  lysine exporter protein LysE/YggA  37.1 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.333091  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2865  L-lysine exporter, putative  36.22 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1653  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.255522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2415  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.33094  hitchhiker  0.00103645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2343  lysine exporter protein LysE/YggA  36.22 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581715  hitchhiker  0.000000535695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2988  L-lysine exporter, putative  38.92 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0310  lysine exporter protein LysE/YggA  37.17 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2359  lysine exporter protein LysE/YggA  35.75 
 
 		 206 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.148285 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20760  L-lysine exporter  37.14 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1651  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.33 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.302942  normal  0.115475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0664  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.22 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.207445  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2024  hypothetical protein  34.85 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0657  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.925476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3059  arginine exporter protein  37 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  0.417322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3305  arginine exporter protein  38.5 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0855  arginine exporter protein  35.68 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984565  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3228  arginine exporter protein  38.5 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3302  arginine exporter protein  38.5 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4362  transporter, LysE family  35.08 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2243  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.85 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.229976  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3348  arginine exporter protein  36.5 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3250  arginine exporter protein  36.5 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4220  arginine exporter protein  36.5 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4058  lysine exporter protein LysE/YggA  35.6 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4432  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0916  amino acid transporter LysE  35.6 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0955  lysine exporter protein LysE/YggA  35.6 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599667  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4472  lysine exporter protein LysE/YggA  35.6 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301556 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1975  lysine exporter protein LysE/YggA  34.59 
 
 		 204 aa  118  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0982  lysine exporter protein LysE/YggA  35.6 
 
 		 199 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248105 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3239  arginine exporter protein  38 
 
 		 211 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5931  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.12 
 
 		 227 aa  117  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0373  lysine exporter protein LysE/YggA  35.08 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2777  amino acid transporter LysE  37.43 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0394  lysine exporter protein LysE/YggA  37.23 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3336  arginine exporter protein  36.32 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.313713  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02754  arginine exporter protein  37 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0770  L-lysine exporter  37 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0787  arginine exporter protein  37 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3081  arginine exporter protein  37 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02717  hypothetical protein  37 
 
 		 211 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3379  lysine exporter protein LysE/YggA  35.68 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1845  lysine exporter protein LysE/YggA  34.41 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.142006  normal  0.0992171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  34.38 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105145 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2975  lysine exporter protein LysE/YggA  36.57 
 
 		 202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.967667  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1960  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3408  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.04 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.554507  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0270  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.71 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.440552 
 
 
-
 
NC_004310  BR0674  amino acid transporter LysE  34.5 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4936  putative transporter  40.31 
 
 		 200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2433  lysine exporter protein (LysE/YggA)  34.27 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2174  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0194  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.93 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0712  lysine exporter protein  37.91 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.94 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00462504  hitchhiker  0.00355468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21230  lysine efflux permease  37.56 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3147  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5006  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3819  arginine exporter protein  35.68 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.771227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0852  arginine exporter protein  35.68 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0116033  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12017  integral membrane protein  34.21 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3927  arginine exporter protein  36 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.481327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2143  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.41 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281653  normal  0.178188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0272  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0282  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.22617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0263  lysine exporter protein LysE/YggA  34.24 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56770  putative transporter  40.21 
 
 		 200 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0557  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.68 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0604  lysine exporter protein LysE/YggA  40.14 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.622207  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3649  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.44 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3446  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.68 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.87 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5299  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 206 aa  104  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4165  lysine exporter protein LysE/YggA  33.14 
 
 		 203 aa  104  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.28578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1397  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.26 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1890  lysine exporter protein LysE/YggA  35.18 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.34738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3883  arginine exporter protein  37 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0385  hypothetical protein  34.38 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3140  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.466671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1449  LysE family translocator protein  33.33 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0643265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1338  lysine exporter protein LysE/YggA  34.2 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.612562  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3748  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.59 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11850  lysine efflux permease  33.5 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00592861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0668  amino acid transporter LysE  34 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.484173  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2966  hypothetical protein  29.84 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10496  integral membrane protein  32.76 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.13012e-26  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2816  hypothetical protein  29.32 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1506  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.07 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4177  lysine exporter protein LysE/YggA  36.84 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00817144  normal  0.249821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5124  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5735  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4488  lysine exporter protein LysE/YggA  32.84 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1114  lysine exporter protein LysE/YggA  37.96 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2124  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.26 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>