More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0677 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0677  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components-like protein  100 
 
 		 239 aa  467  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0972  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.92 
 
 		 244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components-like protein  41.45 
 
 		 234 aa  164  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components-like protein  40.25 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1861  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component-like protein  29.61 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  28.26 
 
 		 627 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  26.7 
 
 		 581 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.79 
 
 		 606 aa  63.2  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  27.23 
 
 		 631 aa  62.8  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2087  ABC transporter related  26.75 
 
 		 579 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  28.7 
 
 		 658 aa  62.4  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3822  ABC transporter transmembrane region  25 
 
 		 605 aa  62  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568746  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  28.7 
 
 		 658 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0386  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.19 
 
 		 593 aa  61.6  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  23.32 
 
 		 618 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0473  ATPase  21.98 
 
 		 588 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  22.96 
 
 		 584 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.11 
 
 		 598 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.66 
 
 		 598 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  27.97 
 
 		 501 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  24.89 
 
 		 579 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.67 
 
 		 598 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0081  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  26.82 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0839  ABC transporter, ATPase subunit  23.5 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.483975  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.32 
 
 		 609 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  24.32 
 
 		 610 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  28.44 
 
 		 638 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  23.74 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  28.96 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.66 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  25.54 
 
 		 642 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  29.09 
 
 		 625 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  27.85 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  24.29 
 
 		 624 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  23.11 
 
 		 660 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  25.78 
 
 		 602 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  24.58 
 
 		 578 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  26.7 
 
 		 584 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  26.51 
 
 		 598 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1451  ABC transporter, ATP-binding protein  24.19 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  25.66 
 
 		 598 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  29.15 
 
 		 582 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1379  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.5 
 
 		 615 aa  56.2  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0620  peptide ABC transporter ATPase  25.94 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000156592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0869  ABC transporter related protein  25.11 
 
 		 564 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.829342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1023  ABC transporter related  28.32 
 
 		 625 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.037611  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11636  transmembrane ATP-binding protein ABC transporter cydC  28.29 
 
 		 576 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.931152  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  26.97 
 
 		 576 aa  55.8  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  26.67 
 
 		 594 aa  55.5  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  25.66 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  24 
 
 		 613 aa  55.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  29.11 
 
 		 588 aa  55.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5678  ABC transporter related  24.17 
 
 		 355 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.992256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  24.14 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  23.11 
 
 		 579 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  23.75 
 
 		 632 aa  55.1  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  21.08 
 
 		 628 aa  55.1  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0989  ABC transporter related  23.21 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.29 
 
 		 596 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1845  ABC transporter related  26.38 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115233  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1310  ABC transporter related  26.67 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1815  ABC transporter  26.44 
 
 		 370 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  22.37 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  26.03 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19290  ABC transporter related  27.24 
 
 		 329 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.715908  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  26.94 
 
 		 589 aa  55.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0353  ABC transporter related  26.47 
 
 		 575 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.78 
 
 		 598 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  24.78 
 
 		 598 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  25.37 
 
 		 596 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  23.79 
 
 		 601 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0823  ABC transporter related  24.5 
 
 		 625 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  26.38 
 
 		 627 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0717  ATPase  25 
 
 		 583 aa  54.3  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000641338  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  22.62 
 
 		 602 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.78 
 
 		 598 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  25.64 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0555  ABC transporter related  29.09 
 
 		 628 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  24.23 
 
 		 612 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  23.61 
 
 		 611 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1010  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.63 
 
 		 629 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.04 
 
 		 632 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  31.43 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  40.58 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  25.22 
 
 		 598 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  25.56 
 
 		 567 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1596  ABC transporter related  21.88 
 
 		 600 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  26.91 
 
 		 655 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1608  ABC transporter related  21.43 
 
 		 600 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  25.55 
 
 		 598 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  22.51 
 
 		 643 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  29.18 
 
 		 571 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.24 
 
 		 586 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  23.93 
 
 		 638 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  24.35 
 
 		 642 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0540  ABC transporter related  24.35 
 
 		 296 aa  52.8  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  25.56 
 
 		 567 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.54 
 
 		 586 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  25.45 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1737  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.11 
 
 		 576 aa  52.8  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000364888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>