More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0869 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0869  ABC transporter related protein  100 
 
 
564 aa  1063    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.829342 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2762  ABC transporter-like protein  55.73 
 
 
557 aa  434  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.03 
 
 
600 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  35.07 
 
 
575 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.8 
 
 
585 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2917  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.57 
 
 
576 aa  260  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.21 
 
 
587 aa  259  6e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.01 
 
 
587 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.16 
 
 
574 aa  258  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.16 
 
 
574 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  32.34 
 
 
592 aa  257  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  35.59 
 
 
582 aa  256  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  31.26 
 
 
579 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  33.33 
 
 
618 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.23 
 
 
587 aa  254  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  35.61 
 
 
578 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1255  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.78 
 
 
597 aa  251  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261223  normal  0.738985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.37 
 
 
596 aa  250  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.44 
 
 
597 aa  250  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.42 
 
 
597 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.87 
 
 
577 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 
596 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 
596 aa  247  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.84 
 
 
600 aa  248  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 
575 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.25 
 
 
575 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.25 
 
 
575 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 
574 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  33 
 
 
546 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.25 
 
 
574 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.07 
 
 
582 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.33 
 
 
594 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.54 
 
 
582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.98 
 
 
594 aa  243  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4984  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.68 
 
 
624 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.18 
 
 
586 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  32.09 
 
 
627 aa  241  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  27.91 
 
 
566 aa  240  4e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  34.52 
 
 
603 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.12 
 
 
582 aa  240  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  36.57 
 
 
581 aa  240  5e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.36 
 
 
594 aa  240  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  31.89 
 
 
601 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.99 
 
 
598 aa  239  8e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  31.97 
 
 
578 aa  239  9e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.76 
 
 
609 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  35.76 
 
 
610 aa  239  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0353  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.21 
 
 
582 aa  239  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693994  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0389  ABC transporter ATP-binding protein  31.65 
 
 
582 aa  239  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  34.66 
 
 
603 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.15 
 
 
623 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.15 
 
 
583 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  33.26 
 
 
571 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0536  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  34.49 
 
 
600 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.742929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.15 
 
 
593 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.16 
 
 
579 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.21 
 
 
583 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  31.74 
 
 
556 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44710  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.18 
 
 
596 aa  238  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  30.59 
 
 
584 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.71 
 
 
589 aa  238  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  31.59 
 
 
575 aa  237  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.21 
 
 
593 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  30.16 
 
 
587 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.8 
 
 
583 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0588  ABC transporter related  37.9 
 
 
579 aa  236  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.95 
 
 
610 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.88 
 
 
582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.59 
 
 
613 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2691  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.33 
 
 
573 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0993753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.5 
 
 
572 aa  234  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.82 
 
 
628 aa  234  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  30.99 
 
 
550 aa  233  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.86 
 
 
583 aa  233  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.59 
 
 
583 aa  233  8.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.82 
 
 
582 aa  233  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.82 
 
 
582 aa  233  9e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.82 
 
 
582 aa  233  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  30.16 
 
 
582 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.16 
 
 
582 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.16 
 
 
582 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.16 
 
 
582 aa  232  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.16 
 
 
582 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  33.63 
 
 
585 aa  232  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.16 
 
 
582 aa  232  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.16 
 
 
582 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  30.16 
 
 
582 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.16 
 
 
582 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.76 
 
 
580 aa  232  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.26 
 
 
590 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  30.25 
 
 
582 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0531  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.91 
 
 
603 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.140782 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  33.11 
 
 
580 aa  229  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1398  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.94 
 
 
582 aa  230  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  33.11 
 
 
580 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  29.11 
 
 
579 aa  229  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.72 
 
 
602 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.21 
 
 
594 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  29.11 
 
 
579 aa  229  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4984  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.72 
 
 
602 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>