More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0100 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components-like protein  100 
 
 
234 aa  462  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0100  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components-like protein  97.86 
 
 
234 aa  455  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0972  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.79 
 
 
244 aa  185  6e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0677  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components-like protein  40.25 
 
 
239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1861  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component-like protein  33.48 
 
 
242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.331612  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1654  ABC transporter related  27.23 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07771  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  26.64 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.71775  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07771  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  26.23 
 
 
269 aa  68.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.263903  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0729  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  26.23 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08641  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.41 
 
 
269 aa  65.1  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.22 
 
 
332 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1525  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  26.42 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.198861  normal  0.606343 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  28.51 
 
 
375 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1089  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.7 
 
 
272 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.745288  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1553  FeS assembly ATPase SufC  28.44 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0292372  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  25.53 
 
 
371 aa  62.4  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  24.89 
 
 
426 aa  62  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  26.22 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3292  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  26.22 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  23.32 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2480  phosphate transporter ATP-binding protein  23.39 
 
 
268 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  26.44 
 
 
305 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1399  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  24.79 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  26.14 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  26.18 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  26.7 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1929  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  25.79 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0696107  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0445  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.22 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2546  ABC transporter related protein  25.93 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0483  phosphate ABC transporter ATPase subunit  27.71 
 
 
277 aa  59.7  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15211  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.7 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08631  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.41 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.296362  hitchhiker  0.00137214 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1269  ABC transporter related  23.5 
 
 
421 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  26.72 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  26.36 
 
 
364 aa  59.7  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  21.72 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  28.12 
 
 
372 aa  59.3  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1467  ABC transporter related protein  27.35 
 
 
219 aa  59.3  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0719  ABC transporter related  25.71 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.380288 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  24.69 
 
 
279 aa  58.9  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0413  FeS assembly ATPase SufC  28.1 
 
 
263 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  25.54 
 
 
377 aa  58.9  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  26.01 
 
 
254 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  25.76 
 
 
375 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1559  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  24.59 
 
 
251 aa  58.5  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  24.15 
 
 
478 aa  58.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  26.61 
 
 
337 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  25.51 
 
 
381 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3143  ABC transporter related  23.38 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0295  ABC transporter related  25.96 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.852806  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2334  phosphate ABC transporter ATPase subunit  25.74 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  23.85 
 
 
260 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  26.64 
 
 
340 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1790  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  27.4 
 
 
297 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530432  decreased coverage  0.00975681 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  27.23 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1227  ABC transporter, ATP-binding protein  26.72 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0975  ABC transporter related  24.69 
 
 
297 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2292  ABC transporter related  28.38 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4407  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  26.67 
 
 
253 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0221693  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  27.35 
 
 
362 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  25.1 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0997  ABC transporter related  24.69 
 
 
297 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.97 
 
 
581 aa  57  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3171  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  26.64 
 
 
333 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.659319  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1090  ABC transporter related  24.07 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  27.16 
 
 
348 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  21.34 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2807  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  23.85 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.377161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  24.35 
 
 
292 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3366  ABC transporter related  24.69 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1879  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.68 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.415603 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2357  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  26.54 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0369029  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  25.12 
 
 
292 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  25.12 
 
 
292 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1009  ABC transporter related  24.69 
 
 
297 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25.94 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1743  ABC transporter-related protein  27.16 
 
 
271 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  22.22 
 
 
318 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  27.39 
 
 
367 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  25.12 
 
 
292 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  25.12 
 
 
292 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  24.58 
 
 
273 aa  56.6  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2832  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  23.24 
 
 
264 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0498  phosphate ABC transporter permease  25.32 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  25.74 
 
 
348 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4495  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  25.45 
 
 
301 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  25.62 
 
 
570 aa  56.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0119  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  23.91 
 
 
369 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2358  phosphate transporter ATP-binding protein  26.02 
 
 
273 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  25.11 
 
 
373 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1510  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  24.18 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  23.24 
 
 
264 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1826  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  27.19 
 
 
250 aa  55.8  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  25.11 
 
 
363 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  26.11 
 
 
351 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0630  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  25.83 
 
 
372 aa  55.8  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000125028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0982  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  24.09 
 
 
253 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0534146 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1468  ABC transporter related protein  25.7 
 
 
257 aa  55.8  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0048  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  25 
 
 
275 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240899  normal  0.357685 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  25.69 
 
 
352 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>