More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1856 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  100 
 
 
686 aa  1348    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1531  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  60.06 
 
 
726 aa  696    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.303438  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  45.84 
 
 
703 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  45.95 
 
 
666 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  44.36 
 
 
690 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  44.43 
 
 
690 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  43.66 
 
 
723 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  45.53 
 
 
717 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  42.96 
 
 
702 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  41.16 
 
 
709 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  42.98 
 
 
692 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  43.39 
 
 
742 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  42.19 
 
 
705 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  40.38 
 
 
697 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  30.54 
 
 
724 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  33.72 
 
 
726 aa  319  7.999999999999999e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  30.99 
 
 
719 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  28.89 
 
 
700 aa  311  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  30.45 
 
 
730 aa  309  9e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  32.15 
 
 
688 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  29.22 
 
 
723 aa  304  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  33.14 
 
 
710 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  34.11 
 
 
711 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  29.99 
 
 
708 aa  301  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  31.27 
 
 
718 aa  300  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  29.57 
 
 
688 aa  297  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  29.53 
 
 
688 aa  297  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  31.95 
 
 
1283 aa  296  8e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  29.53 
 
 
679 aa  294  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  29.96 
 
 
713 aa  293  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  29.54 
 
 
718 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  29.37 
 
 
719 aa  292  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  30.43 
 
 
689 aa  291  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  30.04 
 
 
727 aa  291  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  29.15 
 
 
677 aa  290  8e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  30.04 
 
 
727 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  30.04 
 
 
727 aa  289  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  32.94 
 
 
719 aa  288  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  30.29 
 
 
726 aa  289  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  31.79 
 
 
695 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4842  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.06 
 
 
700 aa  286  8e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  32.89 
 
 
685 aa  285  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  30 
 
 
689 aa  284  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  29.66 
 
 
729 aa  282  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  29.85 
 
 
727 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  29.75 
 
 
727 aa  280  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  29.71 
 
 
727 aa  280  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  29.75 
 
 
727 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  29.79 
 
 
696 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  29.23 
 
 
714 aa  278  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  29.61 
 
 
718 aa  276  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  31.85 
 
 
745 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  27.8 
 
 
685 aa  273  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  28.68 
 
 
719 aa  270  8e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  28.09 
 
 
703 aa  267  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  28.97 
 
 
707 aa  267  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  31.69 
 
 
714 aa  261  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  32.27 
 
 
682 aa  260  8e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  26.74 
 
 
670 aa  259  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  33.47 
 
 
713 aa  257  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  27.39 
 
 
685 aa  253  8.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  28.53 
 
 
701 aa  251  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  28.13 
 
 
703 aa  238  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  30.99 
 
 
704 aa  225  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.91 
 
 
740 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  26.53 
 
 
719 aa  210  9e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  26.69 
 
 
704 aa  205  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  28.16 
 
 
678 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  25.81 
 
 
734 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  29.85 
 
 
682 aa  201  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  26.19 
 
 
732 aa  200  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  30.69 
 
 
705 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  27.71 
 
 
733 aa  194  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  28.42 
 
 
683 aa  194  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  28.28 
 
 
683 aa  194  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  25.94 
 
 
730 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  28.48 
 
 
680 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  28.85 
 
 
682 aa  188  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  27.46 
 
 
685 aa  188  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  29.24 
 
 
688 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  28.25 
 
 
686 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  27.87 
 
 
686 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  30.2 
 
 
703 aa  183  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  27.5 
 
 
685 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  27.61 
 
 
680 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  25.57 
 
 
705 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  25.52 
 
 
688 aa  180  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  25.15 
 
 
697 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  27.83 
 
 
680 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  28.06 
 
 
680 aa  178  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  27.48 
 
 
684 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  30.01 
 
 
698 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  29.64 
 
 
696 aa  175  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3348  Prolyl oligopeptidase  32.94 
 
 
698 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.312251  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  29.19 
 
 
695 aa  174  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  29.33 
 
 
698 aa  173  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  28 
 
 
756 aa  171  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  27.92 
 
 
706 aa  170  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  27.79 
 
 
690 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  25.57 
 
 
686 aa  167  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>