More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4842 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4842  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  100 
 
 
700 aa  1347    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  41.44 
 
 
697 aa  425  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  40.65 
 
 
703 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  40.81 
 
 
690 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  40.68 
 
 
723 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  41.61 
 
 
690 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  42.39 
 
 
666 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  41.31 
 
 
742 aa  397  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  39.45 
 
 
702 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  38.63 
 
 
709 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  39.21 
 
 
705 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  39.83 
 
 
692 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  41.83 
 
 
717 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  38.16 
 
 
686 aa  302  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1531  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.32 
 
 
726 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.303438  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  31.87 
 
 
726 aa  276  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  32.44 
 
 
685 aa  249  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  27.22 
 
 
670 aa  246  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  27.03 
 
 
703 aa  230  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  26.91 
 
 
677 aa  229  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  27.09 
 
 
685 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  31.76 
 
 
719 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  26.7 
 
 
679 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  31.01 
 
 
704 aa  227  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  27.31 
 
 
719 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  30.19 
 
 
710 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  28.31 
 
 
701 aa  223  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  27.42 
 
 
724 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  25.81 
 
 
723 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  28.04 
 
 
1283 aa  221  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  28.47 
 
 
688 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  31.81 
 
 
682 aa  221  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  28.08 
 
 
703 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  26.71 
 
 
730 aa  221  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  28.75 
 
 
689 aa  220  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  31.5 
 
 
711 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  26.65 
 
 
685 aa  219  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  27.18 
 
 
707 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.97 
 
 
740 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  27.67 
 
 
719 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  26.28 
 
 
718 aa  217  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  31.21 
 
 
714 aa  216  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  29.12 
 
 
718 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  25.57 
 
 
700 aa  213  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  27.08 
 
 
719 aa  212  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  30.3 
 
 
745 aa  212  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  27.23 
 
 
689 aa  211  5e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  28.53 
 
 
695 aa  208  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  26.66 
 
 
713 aa  207  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  26.99 
 
 
708 aa  207  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  25.98 
 
 
727 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  26.23 
 
 
729 aa  204  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  25.84 
 
 
726 aa  203  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  26.6 
 
 
718 aa  203  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  26.9 
 
 
727 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  25.95 
 
 
727 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  25.95 
 
 
727 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  26.76 
 
 
727 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  26.93 
 
 
719 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  26.76 
 
 
727 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  26.56 
 
 
688 aa  200  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  26.56 
 
 
688 aa  200  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  26.76 
 
 
727 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  26.77 
 
 
714 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  26.15 
 
 
696 aa  192  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1125  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  43.45 
 
 
721 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00651092  normal  0.350875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  46.31 
 
 
713 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2164  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.96 
 
 
702 aa  180  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.876944  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5931  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.59 
 
 
721 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2146  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.59 
 
 
721 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2612  Prolyl oligopeptidase  42.63 
 
 
699 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.270584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5455  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.59 
 
 
704 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1083  prolyl oligopeptidase family protein  41.86 
 
 
748 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166772  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  38.99 
 
 
702 aa  174  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5550  prolyl oligopeptidase  39.71 
 
 
685 aa  173  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11141  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0927  prolyl oligopeptidase family protein  40.15 
 
 
732 aa  173  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  43.59 
 
 
707 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0367  prolyl oligopeptidase family protein  40.15 
 
 
782 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0734  Prolyl oligopeptidase  34.42 
 
 
681 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0454  prolyl oligopeptidase family protein  40.15 
 
 
698 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0193  prolyl oligopeptidase family protein  40.15 
 
 
772 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1911  serine protease  40.15 
 
 
776 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1824  prolyl oligopeptidase family protein  40.15 
 
 
776 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1414  prolyl oligopeptidase family protein  40.15 
 
 
698 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  40.08 
 
 
711 aa  170  9e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5937  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.19 
 
 
696 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.06347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7360  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.93 
 
 
691 aa  169  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  41.3 
 
 
696 aa  169  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  30.32 
 
 
705 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2056  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.12 
 
 
703 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273173  normal  0.9211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1525  prolyl oligopeptidase family protein  40.94 
 
 
694 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466095  normal  0.0843483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3695  Prolyl oligopeptidase  43.35 
 
 
711 aa  167  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3348  Prolyl oligopeptidase  32.21 
 
 
698 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.312251  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2406  Prolyl oligopeptidase  48.36 
 
 
741 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27550  serine protease, S9A family peptidase  44.1 
 
 
684 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143413  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  27.17 
 
 
733 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.6 
 
 
691 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0018  prolyl oligopeptidase  33.93 
 
 
734 aa  166  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3675  Prolyl oligopeptidase  41.27 
 
 
676 aa  164  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  38.43 
 
 
701 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>