More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2753 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  92.16 
 
 		 727 aa  1408    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  52.92 
 
 		 689 aa  761    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  100 
 
 		 727 aa  1503    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  76.55 
 
 		 714 aa  1171    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  52.22 
 
 		 688 aa  749    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  53.35 
 
 		 689 aa  769    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  92.16 
 
 		 727 aa  1409    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  54.79 
 
 		 688 aa  791    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  45.08 
 
 		 745 aa  680    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  49.34 
 
 		 685 aa  689    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  51.23 
 
 		 695 aa  744    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  51.01 
 
 		 703 aa  746    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  48.75 
 
 		 682 aa  672    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  97.25 
 
 		 727 aa  1468    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  97.52 
 
 		 727 aa  1470    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  47.01 
 
 		 708 aa  665    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  75.52 
 
 		 718 aa  1167    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  48.46 
 
 		 685 aa  651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  97.11 
 
 		 726 aa  1461    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  70.69 
 
 		 718 aa  1098    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  76.28 
 
 		 718 aa  1170    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  92.43 
 
 		 727 aa  1411    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  90.81 
 
 		 729 aa  1394    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  92.16 
 
 		 727 aa  1408    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  52.22 
 
 		 688 aa  749    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  78.81 
 
 		 696 aa  1147    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  45.83 
 
 		 719 aa  625  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  44.63 
 
 		 719 aa  618  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  43.15 
 
 		 724 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  47.12 
 
 		 701 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  44.77 
 
 		 730 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  45.08 
 
 		 713 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  43.68 
 
 		 723 aa  600  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  43.48 
 
 		 710 aa  595  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  44.2 
 
 		 700 aa  592  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  43.92 
 
 		 703 aa  595  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  44.85 
 
 		 679 aa  587  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  43.99 
 
 		 719 aa  587  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  45.15 
 
 		 677 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  41.57 
 
 		 719 aa  568  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  43.46 
 
 		 670 aa  558  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  40.56 
 
 		 719 aa  549  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  40.68 
 
 		 707 aa  544  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  41.51 
 
 		 685 aa  530  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  42.04 
 
 		 711 aa  531  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  38.61 
 
 		 714 aa  505  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  38.36 
 
 		 726 aa  499  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  37.22 
 
 		 713 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.89 
 
 		 740 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  33.52 
 
 		 1283 aa  439  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  35.84 
 
 		 690 aa  435  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  33.76 
 
 		 703 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  34.29 
 
 		 690 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  35.39 
 
 		 702 aa  399  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  33.76 
 
 		 709 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  35.95 
 
 		 723 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  32.46 
 
 		 666 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  32.79 
 
 		 697 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  34.15 
 
 		 692 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  32.43 
 
 		 717 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  34.08 
 
 		 704 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  34.15 
 
 		 742 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  32.72 
 
 		 705 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  30.89 
 
 		 733 aa  299  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  28.31 
 
 		 734 aa  294  5e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  28.02 
 
 		 730 aa  290  7e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  30.32 
 
 		 686 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  28.61 
 
 		 732 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00580  Prolyl endopeptidase, putative  28.46 
 
 		 803 aa  276  9e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  27.17 
 
 		 704 aa  274  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  26.8 
 
 		 705 aa  272  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00350  conserved hypothetical protein  27.73 
 
 		 811 aa  269  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  27.49 
 
 		 688 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  32.44 
 
 		 614 aa  263  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  27.54 
 
 		 682 aa  256  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  27.96 
 
 		 721 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  26.99 
 
 		 705 aa  254  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  27.12 
 
 		 697 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  28.44 
 
 		 686 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  29.9 
 
 		 686 aa  251  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  26.97 
 
 		 686 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5032  prolyl oligopeptidase  27.3 
 
 		 718 aa  244  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  27.01 
 
 		 678 aa  243  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  27.22 
 
 		 690 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  37.17 
 
 		 710 aa  239  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  29.2 
 
 		 696 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  27.67 
 
 		 701 aa  238  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  26.62 
 
 		 719 aa  235  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  26.64 
 
 		 729 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  35.6 
 
 		 695 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  27.84 
 
 		 671 aa  235  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  34.87 
 
 		 696 aa  234  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  28.25 
 
 		 696 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  27.44 
 
 		 702 aa  233  7.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  27.41 
 
 		 711 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  27.12 
 
 		 711 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  27.3 
 
 		 702 aa  231  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  30.1 
 
 		 685 aa  231  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  26.71 
 
 		 711 aa  230  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  27.18 
 
 		 711 aa  230  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>