More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1536 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  60.03 
 
 
742 aa  742    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  61 
 
 
703 aa  793    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  56.55 
 
 
702 aa  714    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  100 
 
 
692 aa  1353    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  57.78 
 
 
690 aa  738    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  53.69 
 
 
709 aa  698    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  54.2 
 
 
666 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  59.6 
 
 
705 aa  751    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  57.67 
 
 
717 aa  696    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  57.7 
 
 
690 aa  773    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  60.03 
 
 
723 aa  749    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  55.71 
 
 
697 aa  708    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  42.61 
 
 
726 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  35.37 
 
 
689 aa  425  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  35.83 
 
 
688 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  38.91 
 
 
745 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  34.1 
 
 
688 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  34.1 
 
 
688 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  39.14 
 
 
685 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  42.84 
 
 
686 aa  415  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  39.77 
 
 
711 aa  414  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  39.43 
 
 
719 aa  415  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  33.62 
 
 
685 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  35.35 
 
 
689 aa  415  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  33.38 
 
 
723 aa  409  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  33.38 
 
 
719 aa  399  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  34.24 
 
 
724 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  31.94 
 
 
703 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  33.96 
 
 
719 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  37.48 
 
 
710 aa  398  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  33.91 
 
 
730 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  35.19 
 
 
718 aa  398  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  33.48 
 
 
708 aa  393  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  35.81 
 
 
1283 aa  395  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  38.94 
 
 
714 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  35.14 
 
 
719 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  36.43 
 
 
695 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  31.26 
 
 
670 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  34.15 
 
 
727 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  31.51 
 
 
700 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  33.86 
 
 
727 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  33.86 
 
 
727 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  33.86 
 
 
726 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  31.94 
 
 
677 aa  379  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  33.43 
 
 
707 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  32.94 
 
 
718 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  33.95 
 
 
729 aa  379  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  31.36 
 
 
679 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  32.86 
 
 
713 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  33.76 
 
 
727 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  33.09 
 
 
714 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  33.76 
 
 
727 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  33.76 
 
 
727 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  34.01 
 
 
696 aa  373  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  33.76 
 
 
727 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  33.57 
 
 
718 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.75 
 
 
740 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  31.9 
 
 
701 aa  363  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1531  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.14 
 
 
726 aa  362  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.303438  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  29.84 
 
 
685 aa  359  9.999999999999999e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  36.55 
 
 
682 aa  359  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  32.09 
 
 
703 aa  350  4e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4842  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.74 
 
 
700 aa  350  5e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  33.82 
 
 
719 aa  339  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  37.78 
 
 
713 aa  333  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  34.93 
 
 
704 aa  315  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  31.05 
 
 
733 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  31.28 
 
 
690 aa  253  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  27.09 
 
 
732 aa  250  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  27.59 
 
 
704 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  27.53 
 
 
614 aa  240  5.999999999999999e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  25.94 
 
 
730 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  32 
 
 
705 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  26.19 
 
 
734 aa  233  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3348  Prolyl oligopeptidase  33.85 
 
 
698 aa  220  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.312251  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  28.86 
 
 
686 aa  219  8.999999999999998e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2612  Prolyl oligopeptidase  43.09 
 
 
699 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.270584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  27.31 
 
 
682 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10470  serine protease, S9A family peptidase  42.2 
 
 
695 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.447718  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  37.5 
 
 
695 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  41.88 
 
 
696 aa  211  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  41.74 
 
 
711 aa  211  5e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1575  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  41.58 
 
 
689 aa  210  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416  hitchhiker  0.0027772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  32.99 
 
 
697 aa  210  8e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  26.85 
 
 
721 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  30.26 
 
 
695 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  42.86 
 
 
697 aa  209  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2164  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.06 
 
 
702 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.876944  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1083  prolyl oligopeptidase family protein  42.49 
 
 
748 aa  208  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166772  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  44 
 
 
702 aa  208  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.08 
 
 
697 aa  208  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  39.6 
 
 
701 aa  208  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5931  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  44.41 
 
 
721 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2146  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.41 
 
 
721 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  42.08 
 
 
697 aa  207  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  42.47 
 
 
697 aa  207  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0927  prolyl oligopeptidase family protein  40.97 
 
 
732 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  40.07 
 
 
696 aa  207  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  41.7 
 
 
697 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1824  prolyl oligopeptidase family protein  40.97 
 
 
776 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>