More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1870 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  47.65 
 
 		 722 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  75.61 
 
 		 695 aa  1115    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  94.4 
 
 		 697 aa  1384    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04132  prolyl oligopeptidase family protein  50.29 
 
 		 697 aa  654    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  90.16 
 
 		 701 aa  1326    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  66.25 
 
 		 710 aa  983    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  90.67 
 
 		 697 aa  1328    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  99.14 
 
 		 697 aa  1438    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  100 
 
 		 697 aa  1449    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10470  serine protease, S9A family peptidase  49.19 
 
 		 695 aa  666    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.447718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  77.76 
 
 		 697 aa  1160    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  91.1 
 
 		 697 aa  1337    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  97.27 
 
 		 697 aa  1419    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  71.89 
 
 		 696 aa  1029    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  90.96 
 
 		 697 aa  1333    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3481  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  50.64 
 
 		 698 aa  664    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.452297 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  45.51 
 
 		 711 aa  618  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  46.53 
 
 		 702 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  46.7 
 
 		 696 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5550  prolyl oligopeptidase  45.64 
 
 		 685 aa  609  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0527  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.72 
 
 		 712 aa  609  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0734  Prolyl oligopeptidase  45.32 
 
 		 681 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4802  Prolyl oligopeptidase  44.41 
 
 		 697 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27550  serine protease, S9A family peptidase  45.89 
 
 		 684 aa  599  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0127  prolyl oligopeptidase  45.95 
 
 		 681 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268487  normal  0.664809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3695  Prolyl oligopeptidase  46.63 
 
 		 711 aa  594  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0785  prolyl oligopeptidase  44.61 
 
 		 676 aa  589  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0018  prolyl oligopeptidase  44.31 
 
 		 734 aa  588  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3675  Prolyl oligopeptidase  46.3 
 
 		 676 aa  588  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0623  prolyl oligopeptidase  44.9 
 
 		 663 aa  582  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0636  prolyl oligopeptidase  44.9 
 
 		 663 aa  582  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0616  prolyl oligopeptidase  44.9 
 
 		 663 aa  582  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08100  serine protease, S9A family peptidase  43.36 
 
 		 718 aa  575  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.64586  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2406  Prolyl oligopeptidase  43.53 
 
 		 741 aa  569  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0714975  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10464  peptidase  43.59 
 
 		 673 aa  560  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46548  predicted protein  42.43 
 
 		 793 aa  547  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1575  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  40.12 
 
 		 689 aa  512  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416  hitchhiker  0.0027772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0822  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.51 
 
 		 767 aa  477  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1125  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.2 
 
 		 721 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00651092  normal  0.350875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.76 
 
 		 770 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5931  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  36.22 
 
 		 721 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662237  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2164  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.36 
 
 		 702 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.876944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2146  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.22 
 
 		 721 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466085  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.57 
 
 		 707 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2056  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.43 
 
 		 703 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273173  normal  0.9211 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0927  prolyl oligopeptidase family protein  38.21 
 
 		 732 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0367  prolyl oligopeptidase family protein  38.21 
 
 		 782 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5455  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  37.02 
 
 		 704 aa  452  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1911  serine protease  37.92 
 
 		 776 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2612  Prolyl oligopeptidase  37.85 
 
 		 699 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.270584 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0454  prolyl oligopeptidase family protein  38.21 
 
 		 698 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0193  prolyl oligopeptidase family protein  38.21 
 
 		 772 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1824  prolyl oligopeptidase family protein  38.21 
 
 		 776 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1414  prolyl oligopeptidase family protein  38.21 
 
 		 698 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1525  prolyl oligopeptidase family protein  36.9 
 
 		 694 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466095  normal  0.0843483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0699  putative prolyl oligopeptidase  36.15 
 
 		 688 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1083  prolyl oligopeptidase family protein  37.48 
 
 		 748 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166772  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7360  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.88 
 
 		 691 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283039  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5937  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  35.59 
 
 		 696 aa  428  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.06347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.41 
 
 		 691 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1218  Prolyl oligopeptidase  31.4 
 
 		 680 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000231766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1073  Prolyl oligopeptidase  31.71 
 
 		 680 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594316  decreased coverage  0.00000514493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  39.34 
 
 		 1283 aa  276  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  30.1 
 
 		 701 aa  271  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  29.26 
 
 		 689 aa  264  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  39.06 
 
 		 719 aa  264  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  29.39 
 
 		 703 aa  260  7e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  29.76 
 
 		 700 aa  259  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  28.92 
 
 		 677 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  29.24 
 
 		 682 aa  255  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  29.24 
 
 		 724 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  48.73 
 
 		 704 aa  254  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  29.49 
 
 		 688 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  29.78 
 
 		 685 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  29.19 
 
 		 713 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  29.34 
 
 		 679 aa  252  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  29.34 
 
 		 688 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  29.34 
 
 		 688 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  29.51 
 
 		 723 aa  243  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  28.59 
 
 		 703 aa  243  7.999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  30.51 
 
 		 719 aa  243  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  29.17 
 
 		 689 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  36.61 
 
 		 726 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  36.67 
 
 		 703 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  36.68 
 
 		 685 aa  240  6.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  35.15 
 
 		 707 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  29.03 
 
 		 719 aa  238  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  29.17 
 
 		 719 aa  238  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  29.76 
 
 		 685 aa  238  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  38.39 
 
 		 745 aa  236  8e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  33.19 
 
 		 696 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  28.51 
 
 		 708 aa  235  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  30 
 
 		 714 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  44.79 
 
 		 711 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  36.89 
 
 		 718 aa  231  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  29.55 
 
 		 719 aa  230  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  43.28 
 
 		 695 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  28.51 
 
 		 666 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 		 697 aa  228  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  28.21 
 
 		 718 aa  227  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>