More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4802 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5550  prolyl oligopeptidase  56.99 
 
 		 685 aa  764    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  53.1 
 
 		 711 aa  733    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3675  Prolyl oligopeptidase  53.15 
 
 		 676 aa  691    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10464  peptidase  50.67 
 
 		 673 aa  685    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0734  Prolyl oligopeptidase  51.18 
 
 		 681 aa  683    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08100  serine protease, S9A family peptidase  48.94 
 
 		 718 aa  639    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.64586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3695  Prolyl oligopeptidase  54.62 
 
 		 711 aa  746    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3481  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  58.82 
 
 		 698 aa  831    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.452297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2406  Prolyl oligopeptidase  52.24 
 
 		 741 aa  719    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0714975  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04132  prolyl oligopeptidase family protein  59.71 
 
 		 697 aa  843    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10470  serine protease, S9A family peptidase  57.29 
 
 		 695 aa  803    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.447718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  59.68 
 
 		 696 aa  842    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0623  prolyl oligopeptidase  52.66 
 
 		 663 aa  697    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4802  Prolyl oligopeptidase  100 
 
 		 697 aa  1438    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0636  prolyl oligopeptidase  52.66 
 
 		 663 aa  697    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0785  prolyl oligopeptidase  51.85 
 
 		 676 aa  694    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27550  serine protease, S9A family peptidase  58.74 
 
 		 684 aa  807    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0616  prolyl oligopeptidase  52.66 
 
 		 663 aa  697    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0127  prolyl oligopeptidase  52.34 
 
 		 681 aa  701    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268487  normal  0.664809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  48.43 
 
 		 702 aa  632  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0822  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  47.17 
 
 		 767 aa  618  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.85 
 
 		 697 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  44.87 
 
 		 695 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  45.84 
 
 		 696 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  44.56 
 
 		 697 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  45.02 
 
 		 701 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  44.41 
 
 		 697 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.99 
 
 		 770 aa  604  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  44.41 
 
 		 697 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  44.56 
 
 		 697 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  44.28 
 
 		 697 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  44 
 
 		 697 aa  595  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  44.41 
 
 		 697 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  42.48 
 
 		 710 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46548  predicted protein  42.88 
 
 		 793 aa  557  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0699  putative prolyl oligopeptidase  42.9 
 
 		 688 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.53 
 
 		 691 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5937  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.61 
 
 		 696 aa  547  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.06347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7360  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  42.94 
 
 		 691 aa  545  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283039  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  43.15 
 
 		 722 aa  541  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1575  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.84 
 
 		 689 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416  hitchhiker  0.0027772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0527  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.38 
 
 		 712 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0018  prolyl oligopeptidase  41.68 
 
 		 734 aa  504  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1083  prolyl oligopeptidase family protein  40.92 
 
 		 748 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166772  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2612  Prolyl oligopeptidase  41.55 
 
 		 699 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.270584 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0927  prolyl oligopeptidase family protein  40.43 
 
 		 732 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0367  prolyl oligopeptidase family protein  40.43 
 
 		 782 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0454  prolyl oligopeptidase family protein  40.43 
 
 		 698 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0193  prolyl oligopeptidase family protein  40.43 
 
 		 772 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1824  prolyl oligopeptidase family protein  40.43 
 
 		 776 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1414  prolyl oligopeptidase family protein  40.43 
 
 		 698 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1911  serine protease  40.14 
 
 		 776 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1125  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.75 
 
 		 721 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00651092  normal  0.350875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5931  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  40.63 
 
 		 721 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2146  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.63 
 
 		 721 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2164  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.49 
 
 		 702 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.876944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1525  prolyl oligopeptidase family protein  39.79 
 
 		 694 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466095  normal  0.0843483 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  40.23 
 
 		 707 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5455  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  40.14 
 
 		 704 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2056  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  39.89 
 
 		 703 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273173  normal  0.9211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1218  Prolyl oligopeptidase  33.24 
 
 		 680 aa  321  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000231766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1073  Prolyl oligopeptidase  33.44 
 
 		 680 aa  321  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594316  decreased coverage  0.00000514493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  30.29 
 
 		 724 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  35.41 
 
 		 719 aa  232  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  37.1 
 
 		 718 aa  229  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  40.98 
 
 		 682 aa  228  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  43.92 
 
 		 689 aa  228  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  29.8 
 
 		 701 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  43.24 
 
 		 703 aa  224  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  37.18 
 
 		 718 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  35.75 
 
 		 729 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  35.22 
 
 		 727 aa  221  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  34.21 
 
 		 726 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  41.73 
 
 		 723 aa  221  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  35.22 
 
 		 726 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  29.48 
 
 		 708 aa  220  7.999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  34.95 
 
 		 727 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  34.95 
 
 		 727 aa  219  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  27.95 
 
 		 688 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  37.73 
 
 		 1283 aa  218  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  35.48 
 
 		 727 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  35.48 
 
 		 727 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  41.97 
 
 		 685 aa  217  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  35.14 
 
 		 714 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  33.06 
 
 		 707 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  26.89 
 
 		 685 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  35.22 
 
 		 727 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  41.12 
 
 		 719 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  35.22 
 
 		 727 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  40.88 
 
 		 689 aa  214  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  40.39 
 
 		 688 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  40.39 
 
 		 688 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  38.58 
 
 		 696 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  37.23 
 
 		 718 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  28.66 
 
 		 677 aa  213  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  37.62 
 
 		 703 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  38.85 
 
 		 719 aa  212  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  45.34 
 
 		 697 aa  210  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  28.07 
 
 		 719 aa  209  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  39.27 
 
 		 700 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>