More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2323 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  50.15 
 
 
685 aa  687    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  54.96 
 
 
723 aa  756    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  48.46 
 
 
727 aa  651    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  53.36 
 
 
689 aa  748    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  53.67 
 
 
719 aa  736    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  53.89 
 
 
708 aa  737    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  53.05 
 
 
730 aa  727    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  50.51 
 
 
685 aa  669    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  49.78 
 
 
682 aa  677    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  54.41 
 
 
700 aa  741    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  52.73 
 
 
677 aa  711    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  53.63 
 
 
724 aa  747    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  52.31 
 
 
703 aa  739    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  53.68 
 
 
688 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  48.61 
 
 
727 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  48.69 
 
 
727 aa  653    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  48.61 
 
 
727 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  53.45 
 
 
688 aa  749    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  51.99 
 
 
679 aa  697    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  48.69 
 
 
727 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  55.6 
 
 
713 aa  766    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  48.32 
 
 
726 aa  648    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  48.11 
 
 
718 aa  652    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  48.4 
 
 
727 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  100 
 
 
685 aa  1414    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  53.45 
 
 
688 aa  748    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  54.23 
 
 
689 aa  757    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  56.98 
 
 
701 aa  777    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  48.55 
 
 
727 aa  651    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  48.71 
 
 
745 aa  691    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  54.77 
 
 
695 aa  740    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  48.55 
 
 
729 aa  650    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  54.68 
 
 
703 aa  734    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  55.93 
 
 
719 aa  769    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  47.36 
 
 
719 aa  632  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  48.22 
 
 
714 aa  631  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  47.99 
 
 
718 aa  626  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  47.47 
 
 
696 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  46.77 
 
 
710 aa  615  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  47.3 
 
 
718 aa  601  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  44.94 
 
 
719 aa  579  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  43.33 
 
 
711 aa  546  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  40.73 
 
 
714 aa  541  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  41.32 
 
 
670 aa  531  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  40.18 
 
 
707 aa  509  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  40.03 
 
 
719 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  37.39 
 
 
726 aa  488  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  36.36 
 
 
1283 aa  452  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  35.82 
 
 
703 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  35.09 
 
 
705 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  35.51 
 
 
690 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  35.28 
 
 
697 aa  421  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  34.64 
 
 
713 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  33.62 
 
 
692 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.61 
 
 
740 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  32.17 
 
 
666 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  34.53 
 
 
690 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  34.53 
 
 
702 aa  396  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  33.71 
 
 
723 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  34.05 
 
 
709 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  33.47 
 
 
704 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  34.1 
 
 
742 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  31.91 
 
 
717 aa  357  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  30.79 
 
 
734 aa  309  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00580  Prolyl endopeptidase, putative  29.85 
 
 
803 aa  302  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  31.38 
 
 
730 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  31.29 
 
 
733 aa  297  4e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  31.69 
 
 
704 aa  291  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5032  prolyl oligopeptidase  29.28 
 
 
718 aa  289  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  30.43 
 
 
732 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  29.35 
 
 
721 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  27.56 
 
 
688 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  30.65 
 
 
614 aa  267  5e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  28.76 
 
 
695 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  27.57 
 
 
686 aa  263  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  27.02 
 
 
697 aa  257  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  29.98 
 
 
696 aa  256  9e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  35.57 
 
 
697 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  27.54 
 
 
686 aa  254  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.81 
 
 
697 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  28.43 
 
 
696 aa  254  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  29.78 
 
 
697 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  27.74 
 
 
678 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  29.66 
 
 
697 aa  251  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  29.01 
 
 
701 aa  250  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  29.61 
 
 
697 aa  249  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  26.81 
 
 
690 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  29.3 
 
 
697 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  29.15 
 
 
697 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  26.02 
 
 
682 aa  246  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  29.56 
 
 
708 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  27.35 
 
 
686 aa  245  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  27.41 
 
 
705 aa  243  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  26.95 
 
 
685 aa  242  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  26.98 
 
 
690 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  27.88 
 
 
683 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  28.84 
 
 
697 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  26.8 
 
 
697 aa  239  8e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  27.22 
 
 
671 aa  238  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  26.85 
 
 
686 aa  237  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>