More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2736 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  53.2 
 
 
689 aa  751    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  76.55 
 
 
727 aa  1171    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  51.73 
 
 
695 aa  739    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  50.3 
 
 
685 aa  689    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  53.79 
 
 
689 aa  775    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  53.06 
 
 
688 aa  750    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  46 
 
 
745 aa  668    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  77.24 
 
 
727 aa  1174    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  53.06 
 
 
688 aa  749    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  77.24 
 
 
727 aa  1174    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  50.37 
 
 
703 aa  731    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  76.83 
 
 
727 aa  1169    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  76.69 
 
 
727 aa  1170    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  100 
 
 
714 aa  1471    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  77.24 
 
 
727 aa  1175    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  76.66 
 
 
726 aa  1167    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  49.04 
 
 
682 aa  666    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  69.36 
 
 
718 aa  1068    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  83.8 
 
 
718 aa  1265    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  77.24 
 
 
727 aa  1174    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  54.48 
 
 
688 aa  781    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  77.95 
 
 
696 aa  1157    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  78.35 
 
 
718 aa  1190    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  76.89 
 
 
729 aa  1168    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  46.25 
 
 
708 aa  632  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  48.22 
 
 
685 aa  631  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  45.53 
 
 
719 aa  616  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  44.23 
 
 
724 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  47.17 
 
 
719 aa  608  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  47.37 
 
 
730 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  43.88 
 
 
700 aa  588  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  45.67 
 
 
701 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  45.54 
 
 
677 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  45.48 
 
 
713 aa  587  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  45.62 
 
 
679 aa  588  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  42.48 
 
 
723 aa  583  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  45.66 
 
 
703 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  43.13 
 
 
710 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  44.08 
 
 
719 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  43.39 
 
 
670 aa  560  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  43.55 
 
 
719 aa  559  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  42.82 
 
 
685 aa  543  1e-153  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  41.78 
 
 
711 aa  522  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  40.98 
 
 
719 aa  521  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  39.58 
 
 
707 aa  512  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  39.17 
 
 
726 aa  490  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  37.81 
 
 
714 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  38.05 
 
 
713 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.67 
 
 
740 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  36.55 
 
 
690 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  33.47 
 
 
1283 aa  418  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  35.33 
 
 
690 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  33.53 
 
 
703 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  35.44 
 
 
697 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  35.06 
 
 
702 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  35.01 
 
 
723 aa  385  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  34.61 
 
 
704 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  33.43 
 
 
709 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  32.36 
 
 
666 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  33.09 
 
 
692 aa  373  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  32.7 
 
 
705 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  34.05 
 
 
742 aa  365  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  31.13 
 
 
717 aa  355  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  28.72 
 
 
734 aa  287  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00580  Prolyl endopeptidase, putative  28.95 
 
 
803 aa  280  5e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  29.47 
 
 
686 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  28.01 
 
 
704 aa  269  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  26.06 
 
 
705 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  27.86 
 
 
733 aa  265  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  30.94 
 
 
614 aa  261  4e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  25.79 
 
 
730 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  27.1 
 
 
682 aa  249  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  26.72 
 
 
688 aa  248  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  28.93 
 
 
697 aa  246  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  27.35 
 
 
705 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  26.68 
 
 
732 aa  240  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  36.68 
 
 
696 aa  240  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  34.88 
 
 
710 aa  238  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  28.38 
 
 
686 aa  236  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  28.87 
 
 
701 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  34.19 
 
 
697 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  26.88 
 
 
686 aa  236  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  29.37 
 
 
702 aa  235  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  30 
 
 
697 aa  234  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  27.43 
 
 
715 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  29.21 
 
 
702 aa  233  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  36.14 
 
 
695 aa  231  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  26.44 
 
 
721 aa  231  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  28.63 
 
 
696 aa  230  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  27.32 
 
 
671 aa  229  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  29.42 
 
 
697 aa  228  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.27 
 
 
697 aa  228  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  27.34 
 
 
704 aa  227  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  27.03 
 
 
686 aa  227  6e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  29.88 
 
 
702 aa  227  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  34.78 
 
 
701 aa  226  8e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  26.57 
 
 
690 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  35.14 
 
 
697 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  35.14 
 
 
697 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  25.03 
 
 
725 aa  224  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>