More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1498 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  100 
 
 		 730 aa  1506    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  57.38 
 
 		 733 aa  880    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  66.81 
 
 		 732 aa  975    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  63.11 
 
 		 704 aa  934    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  61.12 
 
 		 734 aa  924    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5032  prolyl oligopeptidase  34.74 
 
 		 718 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  35.24 
 
 		 705 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  30.46 
 
 		 688 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  29.29 
 
 		 708 aa  302  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  31.38 
 
 		 685 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  29.73 
 
 		 685 aa  298  3e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  30.4 
 
 		 689 aa  296  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  29.25 
 
 		 695 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  30.16 
 
 		 689 aa  291  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  28.92 
 
 		 703 aa  290  5.0000000000000004e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  28.02 
 
 		 727 aa  290  7e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  28.97 
 
 		 726 aa  290  8e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  30.3 
 
 		 719 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  29.09 
 
 		 670 aa  288  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  29.32 
 
 		 745 aa  287  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  28.28 
 
 		 726 aa  287  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  28.24 
 
 		 727 aa  287  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  30.48 
 
 		 682 aa  286  8e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  28.24 
 
 		 727 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  29.96 
 
 		 685 aa  285  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  28.33 
 
 		 727 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  28.33 
 
 		 727 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  30.07 
 
 		 719 aa  283  8.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  28.18 
 
 		 727 aa  283  9e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  28.18 
 
 		 727 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  26.6 
 
 		 719 aa  282  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  28.63 
 
 		 719 aa  282  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  28.97 
 
 		 688 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  27.66 
 
 		 719 aa  281  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  28.82 
 
 		 688 aa  280  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  27.92 
 
 		 730 aa  278  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  29.87 
 
 		 714 aa  274  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  28.49 
 
 		 700 aa  274  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  26.6 
 
 		 718 aa  273  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  29.65 
 
 		 703 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  30.87 
 
 		 690 aa  270  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  26.61 
 
 		 729 aa  269  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  29.05 
 
 		 724 aa  267  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  30.2 
 
 		 690 aa  267  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  26.65 
 
 		 718 aa  264  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  26.76 
 
 		 707 aa  263  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  28.88 
 
 		 701 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  28.65 
 
 		 723 aa  263  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  26.8 
 
 		 679 aa  260  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  26.97 
 
 		 718 aa  257  4e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  28.9 
 
 		 710 aa  256  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  28.59 
 
 		 705 aa  256  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  25.79 
 
 		 714 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  27.09 
 
 		 677 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  28.2 
 
 		 666 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  29.49 
 
 		 711 aa  254  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  27.38 
 
 		 723 aa  253  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  25.99 
 
 		 696 aa  250  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  28.82 
 
 		 697 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  28.37 
 
 		 713 aa  245  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  28.16 
 
 		 703 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  27.43 
 
 		 1283 aa  241  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  27.67 
 
 		 713 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  27.55 
 
 		 702 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  25.94 
 
 		 692 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  28.71 
 
 		 704 aa  229  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  27.85 
 
 		 682 aa  227  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  27.61 
 
 		 717 aa  222  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  26.56 
 
 		 688 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  27.64 
 
 		 697 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.3 
 
 		 740 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  25.86 
 
 		 742 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  26.35 
 
 		 709 aa  215  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  26.42 
 
 		 686 aa  210  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  25.55 
 
 		 686 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  26.16 
 
 		 715 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  25.79 
 
 		 696 aa  203  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  24.51 
 
 		 686 aa  200  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  25 
 
 		 721 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  24.9 
 
 		 685 aa  198  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  26.08 
 
 		 697 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  25.96 
 
 		 686 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  26.15 
 
 		 678 aa  197  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  24.72 
 
 		 701 aa  195  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  26.05 
 
 		 682 aa  193  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  24.61 
 
 		 690 aa  192  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  25.42 
 
 		 683 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  25.42 
 
 		 683 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  25.42 
 
 		 683 aa  190  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  25.42 
 
 		 683 aa  190  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  25.42 
 
 		 683 aa  190  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  25.46 
 
 		 683 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  27.07 
 
 		 684 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  24.93 
 
 		 708 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.27 
 
 		 713 aa  188  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  24.59 
 
 		 686 aa  187  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  24.39 
 
 		 686 aa  187  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  25 
 
 		 686 aa  187  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  25.25 
 
 		 685 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  26.05 
 
 		 711 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>