More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1852 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  79.47 
 
 		 718 aa  1199    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  49.34 
 
 		 682 aa  659    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  77.52 
 
 		 727 aa  1174    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  53.56 
 
 		 689 aa  751    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  76.28 
 
 		 727 aa  1170    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  77.24 
 
 		 727 aa  1171    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  54.15 
 
 		 689 aa  779    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  46.11 
 
 		 745 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  54.12 
 
 		 688 aa  748    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  54.12 
 
 		 688 aa  748    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  49.86 
 
 		 703 aa  723    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  77.1 
 
 		 727 aa  1170    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  76.97 
 
 		 727 aa  1169    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  50.07 
 
 		 685 aa  683    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  76.2 
 
 		 729 aa  1159    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  77.52 
 
 		 727 aa  1173    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  76.93 
 
 		 726 aa  1168    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  52.84 
 
 		 695 aa  747    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  69.68 
 
 		 718 aa  1058    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  55.49 
 
 		 688 aa  776    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  77.38 
 
 		 727 aa  1172    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  100 
 
 		 718 aa  1482    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  83.8 
 
 		 714 aa  1265    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  80 
 
 		 696 aa  1179    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  45.56 
 
 		 708 aa  625  1e-178  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  45.61 
 
 		 719 aa  614  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  43.53 
 
 		 724 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  47.3 
 
 		 685 aa  601  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  46.64 
 
 		 701 aa  597  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  44.95 
 
 		 719 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  43.8 
 
 		 710 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  46.5 
 
 		 703 aa  580  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  43.92 
 
 		 700 aa  580  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  45.1 
 
 		 719 aa  580  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  45.5 
 
 		 730 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  45.07 
 
 		 719 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  44.87 
 
 		 677 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  42.24 
 
 		 723 aa  570  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  44.33 
 
 		 713 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  44.81 
 
 		 679 aa  570  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  43.61 
 
 		 670 aa  558  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  41.58 
 
 		 711 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  41.74 
 
 		 685 aa  522  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  39.97 
 
 		 719 aa  503  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  39.43 
 
 		 707 aa  499  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  39.47 
 
 		 726 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  38.7 
 
 		 714 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  38.25 
 
 		 713 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.37 
 
 		 740 aa  438  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  34.04 
 
 		 1283 aa  420  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  35.08 
 
 		 690 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  33.61 
 
 		 703 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  35.19 
 
 		 690 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  35.11 
 
 		 704 aa  392  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  35.8 
 
 		 702 aa  388  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  35.85 
 
 		 697 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  33.77 
 
 		 709 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  35.35 
 
 		 723 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  33.57 
 
 		 692 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  33.38 
 
 		 705 aa  360  4e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  33.15 
 
 		 742 aa  360  5e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  32.17 
 
 		 666 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  32.59 
 
 		 717 aa  356  8.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  29.11 
 
 		 734 aa  292  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  29.24 
 
 		 733 aa  286  7e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  26.93 
 
 		 705 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  28.3 
 
 		 704 aa  280  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  29.92 
 
 		 686 aa  273  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  31.21 
 
 		 614 aa  268  2.9999999999999995e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00580  Prolyl endopeptidase, putative  28.68 
 
 		 803 aa  266  8e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  26.65 
 
 		 730 aa  264  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  27.91 
 
 		 732 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  26.97 
 
 		 682 aa  254  6e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  28.51 
 
 		 686 aa  250  8e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  25.65 
 
 		 688 aa  237  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  27.04 
 
 		 697 aa  237  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  29.52 
 
 		 686 aa  236  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  26.9 
 
 		 721 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  28.88 
 
 		 696 aa  233  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  28.73 
 
 		 706 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  29.08 
 
 		 706 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3348  Prolyl oligopeptidase  28.34 
 
 		 698 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.312251  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  28.93 
 
 		 706 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  28.53 
 
 		 690 aa  229  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  28.93 
 
 		 706 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  26.28 
 
 		 671 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  28.75 
 
 		 712 aa  228  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  25.92 
 
 		 705 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  27.31 
 
 		 719 aa  228  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  28.21 
 
 		 697 aa  227  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  27.35 
 
 		 696 aa  227  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00350  conserved hypothetical protein  44.66 
 
 		 811 aa  225  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  27.22 
 
 		 714 aa  226  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  34.24 
 
 		 710 aa  225  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  28.05 
 
 		 697 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  27.47 
 
 		 696 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  35.04 
 
 		 696 aa  223  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  34.79 
 
 		 695 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  27.1 
 
 		 686 aa  223  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.62 
 
 		 697 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>