More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1324 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  48.89 
 
 
689 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  51.68 
 
 
714 aa  734    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  56.57 
 
 
711 aa  776    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  48.81 
 
 
689 aa  669    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  46.88 
 
 
688 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  65.29 
 
 
719 aa  917    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  100 
 
 
710 aa  1451    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  46.88 
 
 
688 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  49.41 
 
 
695 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  48.81 
 
 
688 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  48.51 
 
 
745 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  44.36 
 
 
703 aa  617  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  46.77 
 
 
685 aa  615  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  45.1 
 
 
727 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  44.8 
 
 
727 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  44.8 
 
 
727 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  44.8 
 
 
727 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  44.07 
 
 
727 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  44.22 
 
 
727 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  44.22 
 
 
726 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  43.9 
 
 
719 aa  598  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  43.48 
 
 
727 aa  595  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  43.78 
 
 
729 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  43.8 
 
 
718 aa  593  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  43.82 
 
 
719 aa  594  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  44.71 
 
 
713 aa  587  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  47.03 
 
 
685 aa  587  1e-166  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  46.91 
 
 
682 aa  583  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  44.74 
 
 
724 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  43.7 
 
 
718 aa  580  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  42.7 
 
 
708 aa  579  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  43.56 
 
 
696 aa  581  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  43.13 
 
 
714 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  43.94 
 
 
718 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  44.74 
 
 
700 aa  575  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  44.49 
 
 
701 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  43.91 
 
 
730 aa  571  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  43.31 
 
 
723 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  43.53 
 
 
703 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  42.71 
 
 
719 aa  543  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  43.84 
 
 
677 aa  543  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  43.92 
 
 
679 aa  542  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  41.96 
 
 
685 aa  531  1e-149  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  41.14 
 
 
670 aa  529  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  40.15 
 
 
726 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  36.96 
 
 
719 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  36.45 
 
 
707 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  39.3 
 
 
713 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.36 
 
 
740 aa  432  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  38.06 
 
 
690 aa  422  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  37.25 
 
 
690 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  33.9 
 
 
1283 aa  411  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  36.14 
 
 
703 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  35.87 
 
 
697 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  37.34 
 
 
705 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  37.48 
 
 
692 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  36.94 
 
 
723 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  35.04 
 
 
666 aa  389  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  36.56 
 
 
709 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  35.71 
 
 
702 aa  378  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  34.71 
 
 
704 aa  371  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  35.65 
 
 
742 aa  360  4e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  34.84 
 
 
717 aa  344  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  33.49 
 
 
686 aa  297  5e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  29.04 
 
 
734 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  30.32 
 
 
705 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  30.53 
 
 
614 aa  265  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  28.81 
 
 
733 aa  263  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00580  Prolyl endopeptidase, putative  29.29 
 
 
803 aa  259  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  28.79 
 
 
704 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  28.8 
 
 
730 aa  256  7e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  29.63 
 
 
682 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  28.47 
 
 
690 aa  254  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  29.49 
 
 
732 aa  251  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5032  prolyl oligopeptidase  27.26 
 
 
718 aa  248  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  29.2 
 
 
678 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3348  Prolyl oligopeptidase  32.78 
 
 
698 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.312251  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  30.38 
 
 
702 aa  234  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0734  Prolyl oligopeptidase  30.14 
 
 
681 aa  231  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  27.67 
 
 
697 aa  230  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46548  predicted protein  39.51 
 
 
793 aa  230  8e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  30.78 
 
 
706 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  30.64 
 
 
706 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  30.64 
 
 
706 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  28.2 
 
 
686 aa  228  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  27.36 
 
 
721 aa  227  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  28.21 
 
 
685 aa  226  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  28.26 
 
 
697 aa  226  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  28.79 
 
 
696 aa  226  9e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  27.35 
 
 
705 aa  226  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.75 
 
 
697 aa  225  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0623  prolyl oligopeptidase  29.18 
 
 
663 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  28.11 
 
 
697 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0636  prolyl oligopeptidase  29.18 
 
 
663 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0616  prolyl oligopeptidase  29.18 
 
 
663 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  27.93 
 
 
695 aa  224  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  28.07 
 
 
697 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  29.9 
 
 
719 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  29.03 
 
 
696 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  27.94 
 
 
696 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>