More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2373 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  76.83 
 
 
714 aa  1169    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  52.22 
 
 
688 aa  746    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  49.05 
 
 
685 aa  685    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  97.25 
 
 
727 aa  1468    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  53.22 
 
 
689 aa  765    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  75.65 
 
 
718 aa  1167    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  53.35 
 
 
689 aa  769    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  92.98 
 
 
727 aa  1418    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  50.86 
 
 
703 aa  743    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  44.67 
 
 
745 aa  676    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  100 
 
 
727 aa  1501    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  52.22 
 
 
688 aa  747    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  99.72 
 
 
727 aa  1499    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  77.1 
 
 
718 aa  1170    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  55.08 
 
 
688 aa  793    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  48.61 
 
 
685 aa  650    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  99.17 
 
 
726 aa  1487    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  47.15 
 
 
708 aa  665    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  71.11 
 
 
718 aa  1099    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  91.5 
 
 
729 aa  1402    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  48.46 
 
 
682 aa  665    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  92.98 
 
 
727 aa  1418    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  93.26 
 
 
727 aa  1421    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  51.45 
 
 
695 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  92.98 
 
 
727 aa  1419    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  79.53 
 
 
696 aa  1149    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  45.83 
 
 
719 aa  622  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  44.49 
 
 
719 aa  615  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  42.74 
 
 
724 aa  608  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  46.99 
 
 
701 aa  609  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  44.07 
 
 
710 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  43.54 
 
 
723 aa  600  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  45.08 
 
 
713 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  44.49 
 
 
730 aa  598  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  44.06 
 
 
700 aa  591  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  44.77 
 
 
703 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  43.84 
 
 
719 aa  586  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  45.15 
 
 
677 aa  588  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  44.56 
 
 
679 aa  585  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  42.26 
 
 
719 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  43.31 
 
 
670 aa  555  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  41.3 
 
 
719 aa  542  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  40.53 
 
 
707 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  41.8 
 
 
685 aa  533  1e-150  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  42.11 
 
 
711 aa  533  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  39.19 
 
 
714 aa  509  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  38.22 
 
 
726 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  37.22 
 
 
713 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.67 
 
 
740 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  33.38 
 
 
1283 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  35.4 
 
 
690 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  34.38 
 
 
690 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  33.76 
 
 
703 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  35.74 
 
 
723 aa  398  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  35.1 
 
 
702 aa  395  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  33.38 
 
 
697 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  33.19 
 
 
709 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  32.51 
 
 
666 aa  389  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  34.08 
 
 
704 aa  382  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  33.86 
 
 
692 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  34.43 
 
 
742 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  31.95 
 
 
717 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  32.11 
 
 
705 aa  363  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  28.53 
 
 
734 aa  291  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  29.91 
 
 
733 aa  290  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  28.24 
 
 
730 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  30.47 
 
 
686 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00580  Prolyl endopeptidase, putative  27.8 
 
 
803 aa  277  5e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  28.04 
 
 
732 aa  273  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  26.66 
 
 
705 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  27.17 
 
 
704 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00350  conserved hypothetical protein  27.65 
 
 
811 aa  268  4e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  32.28 
 
 
614 aa  263  8.999999999999999e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  27.49 
 
 
688 aa  263  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  30.24 
 
 
686 aa  253  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  27.26 
 
 
697 aa  253  8.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  27.25 
 
 
682 aa  250  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  28.47 
 
 
686 aa  250  8e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  27.82 
 
 
721 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  26.84 
 
 
705 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  27.11 
 
 
686 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5032  prolyl oligopeptidase  27.32 
 
 
718 aa  244  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  29.66 
 
 
696 aa  239  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  27.61 
 
 
690 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  37.17 
 
 
710 aa  237  7e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  27.44 
 
 
671 aa  237  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  26.86 
 
 
729 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  26.89 
 
 
678 aa  235  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  27.53 
 
 
701 aa  234  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  27.48 
 
 
706 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  27.44 
 
 
702 aa  233  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  37.57 
 
 
695 aa  232  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  30.26 
 
 
685 aa  231  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  27.3 
 
 
702 aa  231  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  34.62 
 
 
696 aa  231  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  27.34 
 
 
706 aa  231  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  27.34 
 
 
706 aa  231  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  27.2 
 
 
696 aa  230  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  26.48 
 
 
719 aa  230  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  27.12 
 
 
697 aa  228  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>