More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3530 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  61.36 
 
 
690 aa  794    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  58.32 
 
 
702 aa  759    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  62.18 
 
 
742 aa  796    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  56.28 
 
 
709 aa  748    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  55.63 
 
 
666 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  100 
 
 
717 aa  1405    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  63.01 
 
 
703 aa  853    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  59.55 
 
 
723 aa  762    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  57.57 
 
 
697 aa  734    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  57.79 
 
 
692 aa  714    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  54.89 
 
 
705 aa  690    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  59.34 
 
 
690 aa  804    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  41.28 
 
 
726 aa  479  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  45.53 
 
 
686 aa  450  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  36.19 
 
 
688 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  35.37 
 
 
689 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  39.32 
 
 
685 aa  419  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  34 
 
 
688 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  34 
 
 
688 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1531  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  42.78 
 
 
726 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.303438  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  34.1 
 
 
700 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  34.77 
 
 
689 aa  408  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  35.69 
 
 
719 aa  405  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  33.52 
 
 
719 aa  399  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  34.48 
 
 
730 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  36.09 
 
 
695 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  37.06 
 
 
745 aa  395  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  33.01 
 
 
727 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  32.87 
 
 
727 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  32.43 
 
 
727 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  33.47 
 
 
708 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  33.01 
 
 
727 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  34.29 
 
 
724 aa  392  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  32.87 
 
 
727 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  34.72 
 
 
696 aa  392  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  32.11 
 
 
727 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  31.91 
 
 
726 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  35.61 
 
 
1283 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  32.11 
 
 
727 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  32.1 
 
 
729 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  31.76 
 
 
718 aa  382  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  34.34 
 
 
713 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  32.76 
 
 
723 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  33.56 
 
 
718 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  30.9 
 
 
703 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  37.91 
 
 
682 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  32.51 
 
 
718 aa  369  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  31.91 
 
 
685 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  32.9 
 
 
719 aa  366  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  31.13 
 
 
714 aa  364  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  32.39 
 
 
677 aa  362  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  34.79 
 
 
710 aa  359  9e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  36.69 
 
 
714 aa  358  1.9999999999999998e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  32.29 
 
 
679 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4842  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.54 
 
 
700 aa  354  4e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  37.15 
 
 
711 aa  352  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  34.83 
 
 
719 aa  352  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  32 
 
 
707 aa  348  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  29.9 
 
 
670 aa  347  5e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  32.95 
 
 
701 aa  344  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  30.59 
 
 
685 aa  337  7e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  38.36 
 
 
713 aa  335  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  31.24 
 
 
703 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  32.59 
 
 
719 aa  324  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.5 
 
 
740 aa  317  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  34.67 
 
 
704 aa  303  7.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  33.98 
 
 
705 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  30.55 
 
 
733 aa  256  9e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  27.61 
 
 
730 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  26.29 
 
 
734 aa  234  6e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  27.02 
 
 
732 aa  232  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  26.36 
 
 
704 aa  231  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  29.48 
 
 
690 aa  227  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3348  Prolyl oligopeptidase  33.65 
 
 
698 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.312251  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  26.06 
 
 
614 aa  213  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  27.53 
 
 
696 aa  212  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  32.73 
 
 
695 aa  207  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  29.36 
 
 
678 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5550  prolyl oligopeptidase  42.21 
 
 
685 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11141  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  39.02 
 
 
697 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2406  Prolyl oligopeptidase  50.7 
 
 
741 aa  197  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0714975  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10470  serine protease, S9A family peptidase  32.5 
 
 
695 aa  194  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.447718  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5931  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  48.54 
 
 
721 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2146  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  48.54 
 
 
721 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466085  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0927  prolyl oligopeptidase family protein  46.86 
 
 
732 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  37.99 
 
 
722 aa  193  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  37.3 
 
 
697 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2164  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  48.12 
 
 
702 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.876944  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  46.99 
 
 
707 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  34.8 
 
 
701 aa  192  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0367  prolyl oligopeptidase family protein  46.86 
 
 
782 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  28.95 
 
 
682 aa  192  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  40.27 
 
 
711 aa  192  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0454  prolyl oligopeptidase family protein  46.86 
 
 
698 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0193  prolyl oligopeptidase family protein  46.86 
 
 
772 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1911  serine protease  46.86 
 
 
776 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1824  prolyl oligopeptidase family protein  46.86 
 
 
776 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1414  prolyl oligopeptidase family protein  46.86 
 
 
698 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5455  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  47.15 
 
 
704 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  36.66 
 
 
697 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>