More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2212 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  58.35 
 
 
717 aa  767    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  58.31 
 
 
742 aa  768    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  57.14 
 
 
666 aa  751    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  100 
 
 
702 aa  1420    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  68.31 
 
 
697 aa  944    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  56.88 
 
 
709 aa  794    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  67.81 
 
 
690 aa  926    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  66.15 
 
 
703 aa  932    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  54.08 
 
 
705 aa  693    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  60.68 
 
 
723 aa  825    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  56.55 
 
 
692 aa  729    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  64.99 
 
 
690 aa  905    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  39.25 
 
 
726 aa  465  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  37.25 
 
 
688 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  42.96 
 
 
686 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  36.01 
 
 
689 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  35.19 
 
 
724 aa  430  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  35.89 
 
 
688 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  35.75 
 
 
688 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  36.56 
 
 
718 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  35.61 
 
 
719 aa  424  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  36.71 
 
 
689 aa  423  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  38.64 
 
 
695 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  36.57 
 
 
1283 aa  422  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  35.87 
 
 
719 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  38.41 
 
 
685 aa  416  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  35.29 
 
 
727 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  33.38 
 
 
703 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  35.34 
 
 
696 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  33.86 
 
 
723 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  34.53 
 
 
685 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  34.78 
 
 
718 aa  412  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  35.49 
 
 
713 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  34.96 
 
 
708 aa  412  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  33.29 
 
 
700 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  35.85 
 
 
730 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  34.71 
 
 
729 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  35.24 
 
 
727 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  35.1 
 
 
727 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  35.1 
 
 
727 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  35.1 
 
 
726 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  34.96 
 
 
727 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  35.1 
 
 
727 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  35.1 
 
 
727 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  35.8 
 
 
718 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  35.06 
 
 
714 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  33.91 
 
 
719 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  33.38 
 
 
679 aa  398  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  33.09 
 
 
670 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  33.81 
 
 
677 aa  398  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  35.71 
 
 
710 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  36.36 
 
 
745 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  36.98 
 
 
719 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4842  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.45 
 
 
700 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  36.77 
 
 
711 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1531  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.42 
 
 
726 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.303438  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  36.53 
 
 
682 aa  367  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  31.59 
 
 
707 aa  363  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  32.42 
 
 
685 aa  359  9.999999999999999e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  32.71 
 
 
701 aa  357  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  34.9 
 
 
714 aa  355  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  37.21 
 
 
704 aa  354  4e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  33.62 
 
 
719 aa  351  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  31.84 
 
 
703 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  35.94 
 
 
713 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.87 
 
 
740 aa  317  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  27.65 
 
 
734 aa  266  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  30.56 
 
 
733 aa  262  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  27.89 
 
 
704 aa  249  9e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  27.55 
 
 
730 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  25.9 
 
 
732 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3348  Prolyl oligopeptidase  33.66 
 
 
698 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.312251  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  27.76 
 
 
614 aa  228  4e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  29.69 
 
 
705 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  27.59 
 
 
695 aa  219  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  42.58 
 
 
701 aa  217  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  42.58 
 
 
697 aa  217  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  42.58 
 
 
697 aa  217  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  42.58 
 
 
697 aa  217  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  28.05 
 
 
690 aa  216  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  27.39 
 
 
697 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  28.36 
 
 
697 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.21 
 
 
697 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  28.21 
 
 
697 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  26.87 
 
 
688 aa  213  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  41.8 
 
 
697 aa  211  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  37.58 
 
 
696 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  28.59 
 
 
678 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  27.74 
 
 
686 aa  206  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00580  Prolyl endopeptidase, putative  26.08 
 
 
803 aa  204  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5550  prolyl oligopeptidase  43.07 
 
 
685 aa  204  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11141  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  29.58 
 
 
685 aa  204  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1525  prolyl oligopeptidase family protein  42.91 
 
 
694 aa  204  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466095  normal  0.0843483 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  40.14 
 
 
711 aa  202  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  26.14 
 
 
721 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  40.71 
 
 
710 aa  201  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10470  serine protease, S9A family peptidase  40.71 
 
 
695 aa  201  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.447718  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  35.12 
 
 
722 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2612  Prolyl oligopeptidase  43.77 
 
 
699 aa  201  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.270584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  29.03 
 
 
683 aa  200  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>