More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5550 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  55.6 
 
 
711 aa  756    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  52.84 
 
 
696 aa  729    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08100  serine protease, S9A family peptidase  52.14 
 
 
718 aa  675    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.64586  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0734  Prolyl oligopeptidase  57.89 
 
 
681 aa  773    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2406  Prolyl oligopeptidase  54.92 
 
 
741 aa  711    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0714975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4802  Prolyl oligopeptidase  56.99 
 
 
697 aa  764    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0623  prolyl oligopeptidase  59.85 
 
 
663 aa  790    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10464  peptidase  58.35 
 
 
673 aa  775    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3695  Prolyl oligopeptidase  56.56 
 
 
711 aa  729    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10470  serine protease, S9A family peptidase  57.78 
 
 
695 aa  783    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.447718  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5550  prolyl oligopeptidase  100 
 
 
685 aa  1379    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11141  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04132  prolyl oligopeptidase family protein  55.61 
 
 
697 aa  753    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0636  prolyl oligopeptidase  59.85 
 
 
663 aa  790    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3675  Prolyl oligopeptidase  55.9 
 
 
676 aa  724    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0785  prolyl oligopeptidase  60.15 
 
 
676 aa  800    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3481  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  56.48 
 
 
698 aa  767    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.452297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27550  serine protease, S9A family peptidase  66.07 
 
 
684 aa  904    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143413  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0616  prolyl oligopeptidase  59.85 
 
 
663 aa  790    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0127  prolyl oligopeptidase  60.66 
 
 
681 aa  800    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268487  normal  0.664809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  53.31 
 
 
702 aa  677    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  45.94 
 
 
697 aa  620  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  45.12 
 
 
695 aa  615  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  46.97 
 
 
696 aa  618  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  46.29 
 
 
710 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  45.64 
 
 
697 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  45.64 
 
 
697 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.43 
 
 
770 aa  608  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  45.49 
 
 
697 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  45.12 
 
 
697 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  45.12 
 
 
697 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  44.9 
 
 
697 aa  598  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1575  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  46.41 
 
 
689 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416  hitchhiker  0.0027772 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  45.12 
 
 
697 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0822  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  48.21 
 
 
767 aa  598  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  44.85 
 
 
701 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5937  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.18 
 
 
696 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.06347 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46548  predicted protein  43.73 
 
 
793 aa  565  1.0000000000000001e-159  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7360  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  45.37 
 
 
691 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  47.34 
 
 
691 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0527  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.62 
 
 
712 aa  555  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  44.28 
 
 
722 aa  551  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2612  Prolyl oligopeptidase  45.83 
 
 
699 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.270584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0699  putative prolyl oligopeptidase  42.92 
 
 
688 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593093  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0018  prolyl oligopeptidase  43.97 
 
 
734 aa  520  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1525  prolyl oligopeptidase family protein  43.54 
 
 
694 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466095  normal  0.0843483 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  43.64 
 
 
707 aa  505  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1125  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  43.73 
 
 
721 aa  505  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00651092  normal  0.350875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2056  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  43.5 
 
 
703 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273173  normal  0.9211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2164  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.38 
 
 
702 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.876944  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5455  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  43.21 
 
 
704 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5931  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.38 
 
 
721 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2146  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.38 
 
 
721 aa  491  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466085  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0927  prolyl oligopeptidase family protein  41.94 
 
 
732 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0367  prolyl oligopeptidase family protein  41.94 
 
 
782 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0454  prolyl oligopeptidase family protein  41.94 
 
 
698 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0193  prolyl oligopeptidase family protein  41.94 
 
 
772 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1824  prolyl oligopeptidase family protein  41.94 
 
 
776 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1414  prolyl oligopeptidase family protein  41.94 
 
 
698 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1083  prolyl oligopeptidase family protein  41.78 
 
 
748 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166772  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1911  serine protease  41.8 
 
 
776 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1218  Prolyl oligopeptidase  38.91 
 
 
680 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000231766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1073  Prolyl oligopeptidase  38.67 
 
 
680 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594316  decreased coverage  0.00000514493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  30.15 
 
 
1283 aa  255  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  27.63 
 
 
703 aa  237  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  27.8 
 
 
689 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  30.04 
 
 
701 aa  233  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  30.56 
 
 
695 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  38.24 
 
 
726 aa  227  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  30.46 
 
 
719 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  29.12 
 
 
730 aa  225  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  28.75 
 
 
688 aa  221  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  27.44 
 
 
700 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  30.17 
 
 
677 aa  221  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  35.28 
 
 
689 aa  219  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  36.31 
 
 
688 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  36.31 
 
 
688 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  31.48 
 
 
697 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  36.26 
 
 
719 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  39.62 
 
 
709 aa  214  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  35.73 
 
 
711 aa  213  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  32.96 
 
 
723 aa  212  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  39.01 
 
 
685 aa  212  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  38.7 
 
 
704 aa  212  2e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  26.95 
 
 
708 aa  211  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  28.34 
 
 
682 aa  210  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  36.8 
 
 
719 aa  209  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  30.03 
 
 
710 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  39.12 
 
 
745 aa  208  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  41.22 
 
 
724 aa  208  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  35.6 
 
 
726 aa  208  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  35.23 
 
 
727 aa  207  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  31.23 
 
 
703 aa  207  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  35.6 
 
 
727 aa  206  8e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  35.6 
 
 
727 aa  207  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  36.24 
 
 
703 aa  206  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  35.87 
 
 
718 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  36.56 
 
 
729 aa  206  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  35.71 
 
 
707 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  37.15 
 
 
727 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  35.79 
 
 
714 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>