More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2047 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  46.91 
 
 
722 aa  636    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10470  serine protease, S9A family peptidase  47.58 
 
 
695 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.447718  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  100 
 
 
697 aa  1451    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  65.36 
 
 
710 aa  976    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  75.75 
 
 
695 aa  1125    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  90.96 
 
 
697 aa  1333    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  91.1 
 
 
697 aa  1338    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  94.84 
 
 
697 aa  1391    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  94.4 
 
 
697 aa  1384    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  78.62 
 
 
697 aa  1168    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3481  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  50.35 
 
 
698 aa  663    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.452297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  90.82 
 
 
697 aa  1333    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  95.27 
 
 
697 aa  1393    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  72.34 
 
 
696 aa  1033    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  90.73 
 
 
701 aa  1333    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04132  prolyl oligopeptidase family protein  49.86 
 
 
697 aa  650    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  46.32 
 
 
696 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0527  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  44.72 
 
 
712 aa  613  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1717  Prolyl oligopeptidase  44.85 
 
 
711 aa  609  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  45.52 
 
 
702 aa  604  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4802  Prolyl oligopeptidase  44.56 
 
 
697 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0734  Prolyl oligopeptidase  45.31 
 
 
681 aa  601  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5550  prolyl oligopeptidase  44.9 
 
 
685 aa  598  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11141  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3675  Prolyl oligopeptidase  46.14 
 
 
676 aa  588  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0018  prolyl oligopeptidase  43.88 
 
 
734 aa  583  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0785  prolyl oligopeptidase  44.61 
 
 
676 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.770159  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0127  prolyl oligopeptidase  45.31 
 
 
681 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268487  normal  0.664809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27550  serine protease, S9A family peptidase  45.01 
 
 
684 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143413  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3695  Prolyl oligopeptidase  45.3 
 
 
711 aa  579  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0623  prolyl oligopeptidase  44.61 
 
 
663 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0636  prolyl oligopeptidase  44.61 
 
 
663 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0616  prolyl oligopeptidase  44.61 
 
 
663 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08100  serine protease, S9A family peptidase  43.1 
 
 
718 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.64586  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2406  Prolyl oligopeptidase  43.02 
 
 
741 aa  570  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0714975  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10464  peptidase  43.07 
 
 
673 aa  557  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46548  predicted protein  41.61 
 
 
793 aa  531  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560157  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1575  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  39.09 
 
 
689 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416  hitchhiker  0.0027772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0822  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.49 
 
 
767 aa  475  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1125  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.78 
 
 
721 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00651092  normal  0.350875 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2164  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.93 
 
 
702 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.876944  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5931  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  36.78 
 
 
721 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.662237  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.63 
 
 
770 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2146  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.78 
 
 
721 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5455  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  37.16 
 
 
704 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2183  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.57 
 
 
707 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1525  prolyl oligopeptidase family protein  37.92 
 
 
694 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466095  normal  0.0843483 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2056  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  36.29 
 
 
703 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.273173  normal  0.9211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2612  Prolyl oligopeptidase  37.85 
 
 
699 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.270584 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0927  prolyl oligopeptidase family protein  37.64 
 
 
732 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0367  prolyl oligopeptidase family protein  37.64 
 
 
782 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0454  prolyl oligopeptidase family protein  37.77 
 
 
698 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0193  prolyl oligopeptidase family protein  37.64 
 
 
772 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1911  serine protease  37.64 
 
 
776 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1824  prolyl oligopeptidase family protein  37.64 
 
 
776 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1414  prolyl oligopeptidase family protein  37.77 
 
 
698 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1083  prolyl oligopeptidase family protein  37.27 
 
 
748 aa  444  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166772  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7360  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.47 
 
 
691 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0699  putative prolyl oligopeptidase  35.23 
 
 
688 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593093  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5937  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.61 
 
 
696 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.06347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.63 
 
 
691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1218  Prolyl oligopeptidase  31.35 
 
 
680 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000231766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1073  Prolyl oligopeptidase  31.54 
 
 
680 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.594316  decreased coverage  0.00000514493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  38.68 
 
 
1283 aa  275  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  30.2 
 
 
701 aa  272  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  30.64 
 
 
724 aa  269  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  29.34 
 
 
689 aa  264  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  39.06 
 
 
719 aa  264  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  28.94 
 
 
703 aa  263  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  29.56 
 
 
700 aa  260  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  28.97 
 
 
703 aa  256  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  28.96 
 
 
677 aa  256  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  29.77 
 
 
713 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  28.33 
 
 
679 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  28.8 
 
 
688 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  28.65 
 
 
682 aa  251  4e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  29.61 
 
 
685 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  47.62 
 
 
704 aa  249  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  29.96 
 
 
703 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  30 
 
 
723 aa  246  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  30.7 
 
 
719 aa  244  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  40.32 
 
 
688 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  40.32 
 
 
688 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  29.36 
 
 
719 aa  243  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  29 
 
 
685 aa  241  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  35.69 
 
 
707 aa  241  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  29.27 
 
 
708 aa  241  4e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  29.47 
 
 
719 aa  239  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  37.58 
 
 
745 aa  239  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  39.87 
 
 
689 aa  237  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  36.24 
 
 
726 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  29.22 
 
 
730 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  29.12 
 
 
685 aa  233  8.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  44.4 
 
 
711 aa  230  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  30.76 
 
 
719 aa  230  9e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  28.12 
 
 
666 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  39.67 
 
 
670 aa  228  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  36.61 
 
 
718 aa  226  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  28.84 
 
 
696 aa  226  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  42.54 
 
 
695 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  28.07 
 
 
697 aa  225  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>