71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3375 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  100 
 
 
192 aa  350  8.999999999999999e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  57.89 
 
 
185 aa  207  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  50 
 
 
186 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  53.37 
 
 
179 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  48.84 
 
 
186 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  46.03 
 
 
208 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  45.81 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  44.32 
 
 
193 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  48 
 
 
186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  45.29 
 
 
186 aa  127  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  42.39 
 
 
190 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  40.21 
 
 
190 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  44.21 
 
 
186 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  42.51 
 
 
212 aa  121  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  40.21 
 
 
283 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  42.33 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  42.33 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  39.89 
 
 
203 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  44.32 
 
 
207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  42.62 
 
 
207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  40.45 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  40.45 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  42.51 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  41.67 
 
 
208 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  40.68 
 
 
194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  36.41 
 
 
206 aa  104  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  42.94 
 
 
191 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  41.62 
 
 
220 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  40.32 
 
 
215 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  37.87 
 
 
204 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  34.08 
 
 
194 aa  95.9  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  34.32 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  36.08 
 
 
207 aa  85.5  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  35.79 
 
 
254 aa  85.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  34.88 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  33.75 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  29.48 
 
 
177 aa  65.1  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  32.88 
 
 
198 aa  62.4  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  29.89 
 
 
185 aa  62.4  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  33.73 
 
 
244 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  30.43 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  30.72 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  29.81 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  29.81 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  35.98 
 
 
417 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  27.93 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  27.06 
 
 
174 aa  52.4  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  28.12 
 
 
228 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  26.29 
 
 
184 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  26.78 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  25.58 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  27.65 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04730  hypothetical protein  31.48 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  25.69 
 
 
175 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  22.89 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  33.97 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1156  hypothetical protein  32.52 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149709  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  26.59 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  27.75 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  29.19 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  29.63 
 
 
189 aa  45.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  34.03 
 
 
196 aa  44.7  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  28.24 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  26.14 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  28.12 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  30.43 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  31.88 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  26.45 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  27.27 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  28.46 
 
 
195 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  26.71 
 
 
185 aa  41.2  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>