45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0444 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  334  3.9999999999999995e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  37.34 
 
 
177 aa  105  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  37.27 
 
 
185 aa  99  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1156  hypothetical protein  39.58 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149709  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  38.02 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  35.98 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  34.74 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  33.54 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  42.59 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  29.65 
 
 
203 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  29.69 
 
 
203 aa  62.4  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  29.65 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  32.94 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  32.5 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  27.84 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  33.75 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  33.75 
 
 
192 aa  58.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  31.33 
 
 
194 aa  57.8  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  32.92 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  31.74 
 
 
207 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  31.52 
 
 
283 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  30.72 
 
 
174 aa  55.1  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  29.89 
 
 
208 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  32.6 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  36.14 
 
 
191 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  28.26 
 
 
219 aa  52  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  28.74 
 
 
207 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  28.26 
 
 
219 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  34.34 
 
 
212 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  30.95 
 
 
190 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  37.5 
 
 
191 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  32.94 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  26.49 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  27.68 
 
 
228 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  31.67 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  31.15 
 
 
220 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  27.06 
 
 
183 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  29.09 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  31.76 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  28.48 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2780  hypothetical protein  25.44 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2723  hypothetical protein  25.44 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  28.81 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  29.3 
 
 
254 aa  41.2  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>