48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0410 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  60.94 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  56.76 
 
 		 203 aa  208  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  53.12 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  52.6 
 
 		 203 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  55.49 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  35.42 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  41.71 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  40.64 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  35.94 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  39.44 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  39.43 
 
 		 179 aa  98.2  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  38.71 
 
 		 219 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  38.71 
 
 		 219 aa  98.2  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  34.46 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  38.46 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  36.96 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  34.21 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  36.08 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  32.79 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  38.62 
 
 		 186 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  37.64 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  34.57 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  36.31 
 
 		 194 aa  85.5  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  36.96 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  34.64 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  34.39 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  34.41 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  32.65 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  35.71 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  28.72 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  28.49 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  33.71 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  29.26 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  26.11 
 
 		 177 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  31.86 
 
 		 175 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  31.25 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  26.32 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  24.75 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  40.7 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  35.16 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  25.44 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  26.94 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  28.06 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  36.23 
 
 		 190 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  30.38 
 
 		 196 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  25.56 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  25.93 
 
 		 244 aa  41.6  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>