32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8191 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  100 
 
 
211 aa  407  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  42.78 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  41.85 
 
 
192 aa  135  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  41.67 
 
 
228 aa  131  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  40.11 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  40.96 
 
 
197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0343  hypothetical protein  35.71 
 
 
214 aa  118  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  36.97 
 
 
193 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  38.82 
 
 
193 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  38.82 
 
 
193 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1909  hypothetical protein  31.82 
 
 
326 aa  61.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.294784  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4412  hypothetical protein  32.18 
 
 
189 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  26.24 
 
 
184 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  28.8 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  30.65 
 
 
196 aa  51.6  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0746  hypothetical protein  25 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0392117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  31.35 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  29.55 
 
 
187 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  28.33 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  35.71 
 
 
185 aa  49.3  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  24.56 
 
 
283 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  26.01 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  26.19 
 
 
182 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  25.15 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  31.76 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  27.84 
 
 
185 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  27.98 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  28.32 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0950  hypothetical protein  23.75 
 
 
185 aa  42.7  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.148673  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0833  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  26.9 
 
 
186 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  28.57 
 
 
207 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>