53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2789 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  358  3e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  97.33 
 
 
187 aa  352  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  41.67 
 
 
196 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  39.46 
 
 
187 aa  134  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  39.23 
 
 
187 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  39.23 
 
 
255 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  121  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  31.67 
 
 
182 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  31.36 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  37.2 
 
 
192 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  32.78 
 
 
182 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  33.72 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  30.05 
 
 
200 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  32.35 
 
 
186 aa  91.7  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  33.14 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  28.14 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  32.91 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  27.27 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  32.62 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  26.78 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  27.78 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  27.65 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  28.79 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1810  hypothetical protein  30.38 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.404127 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  28.02 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  24.12 
 
 
187 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  26.32 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  24.19 
 
 
192 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  27.32 
 
 
176 aa  57.8  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  26.09 
 
 
196 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  27.91 
 
 
193 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4326  hypothetical protein  25.95 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  24.43 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  25.6 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32866  predicted protein  28.73 
 
 
224 aa  52.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  25.93 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  24.58 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  29.2 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  24.87 
 
 
195 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  27.63 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0833  hypothetical protein  23.13 
 
 
183 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1798  hypothetical protein  24.28 
 
 
185 aa  45.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1475  hypothetical protein  24.28 
 
 
185 aa  45.1  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  24.81 
 
 
175 aa  44.7  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  27.34 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  27.21 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  35.44 
 
 
188 aa  42  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12131  hypothetical protein  29.21 
 
 
169 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1597  hypothetical protein  27.18 
 
 
167 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.585273  hitchhiker  0.00302287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  28.66 
 
 
207 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  26.61 
 
 
210 aa  41.6  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  24.47 
 
 
203 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  24.63 
 
 
203 aa  40.8  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>