74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4019 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  69.68 
 
 		 190 aa  255  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  64.89 
 
 		 192 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  57.95 
 
 		 196 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  64.89 
 
 		 191 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  64.62 
 
 		 193 aa  215  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  52.72 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  38.33 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  34.59 
 
 		 196 aa  95.5  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  31.11 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  84.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4326  hypothetical protein  34.48 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  30.73 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  35.37 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  29.83 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  28.16 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  29.59 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  27.32 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  29.88 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  28.14 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  31.82 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  27.98 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06381  hypothetical protein  32.18 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  28.26 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  27.93 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  30.06 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  24.87 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  27.12 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  28.16 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  23.71 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  27.55 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  28.93 
 
 		 176 aa  52.4  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  25.91 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  26.47 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  28.73 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  30.36 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3813  acid-resistance membrane protein  27.65 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4870  acid-resistance membrane protein  27.65 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.756215 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3909  acid-resistance membrane protein  27.65 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03312  hypothetical protein  27.65 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  29.69 
 
 		 175 aa  49.3  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0203  putative HdeD protein  27.65 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0206  acid-resistance membrane protein  27.65 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03359  acid-resistance membrane protein  27.65 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.493233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3859  acid-resistance membrane protein  31.54 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3997  acid-resistance membrane protein  27.65 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3713  acid-resistance membrane protein  27.65 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00199236  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  27.11 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  28.18 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  25.95 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1092  acid-resistance membrane protein  25.99 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0502  acid-resistance membrane protein  25.99 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0564  acid-resistance membrane protein  25.99 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0489975  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  24 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  27.4 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  26.54 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  28.42 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4460  hypothetical protein  27.87 
 
 		 457 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  31.25 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  28.75 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  27.89 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  28.75 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  28.75 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  38.27 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  34.55 
 
 		 207 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  24.55 
 
 		 185 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0833  hypothetical protein  27.14 
 
 		 183 aa  42  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  34.26 
 
 		 207 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  37.04 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  25.81 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  25.13 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>