41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0566 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  343  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  59.32 
 
 		 187 aa  206  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  59.32 
 
 		 255 aa  204  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  56.04 
 
 		 182 aa  204  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  59.89 
 
 		 187 aa  204  8e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  56.59 
 
 		 182 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  45.09 
 
 		 185 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  44.44 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  31.36 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  35.91 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  36.9 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  36.69 
 
 		 183 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  36.24 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  32.72 
 
 		 192 aa  87.8  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  28.49 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  26.54 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1810  hypothetical protein  34.53 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.404127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  28.07 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  28.33 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  25 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  25.14 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  28.48 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  23.76 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  26.32 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  28.41 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  30.88 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  30.06 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  27.42 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  26.86 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  30.06 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  28.57 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4326  hypothetical protein  25.14 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  22.02 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  31.58 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  27.59 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  30.77 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  27.39 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06381  hypothetical protein  30.06 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  31.65 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1597  hypothetical protein  26.85 
 
 		 167 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.585273  hitchhiker  0.00302287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>