48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3980 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  348  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  59.43 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  46.51 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  46.51 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  47.67 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  47.37 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  43.68 
 
 		 192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  39.57 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  47.37 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  39.11 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  40.33 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  37.99 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  38.71 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  37.99 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  37.36 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  41.71 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  38.17 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  37.16 
 
 		 190 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  38.6 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  37.43 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  37.43 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  42.07 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  38.62 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  98.2  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  40.23 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  36.79 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  38.24 
 
 		 212 aa  94.4  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  40.91 
 
 		 191 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  39.78 
 
 		 207 aa  89  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  36.87 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  35.88 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  32.2 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  28.88 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  28.98 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  31.03 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  29.03 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  29.71 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  27.38 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  30.54 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  24.71 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  25.88 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  25.86 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  25.81 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  30.17 
 
 		 417 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  30.36 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  26.67 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>