55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3835 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  353  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  45.95 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  42.47 
 
 
185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  39.66 
 
 
182 aa  122  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  44.38 
 
 
179 aa  119  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  40.21 
 
 
192 aa  118  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  44 
 
 
191 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  41.62 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  40.57 
 
 
190 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  39.88 
 
 
186 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  35.75 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  37.23 
 
 
207 aa  104  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  37.5 
 
 
186 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  37.71 
 
 
208 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  38.89 
 
 
283 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  36.56 
 
 
207 aa  101  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  36.96 
 
 
186 aa  101  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  37.71 
 
 
194 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  39.18 
 
 
212 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  34.9 
 
 
219 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  34.9 
 
 
219 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  45.14 
 
 
191 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  35.84 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  39.18 
 
 
207 aa  92.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  38.8 
 
 
196 aa  91.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  35.29 
 
 
183 aa  88.2  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  35.2 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  32.96 
 
 
203 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  32.26 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  28.65 
 
 
194 aa  72  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  30.17 
 
 
203 aa  72  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  30.17 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  31.76 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  32.4 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  35.04 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  37.23 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  29.38 
 
 
197 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  32.92 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  27.33 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  30.43 
 
 
189 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  25.84 
 
 
192 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  32.99 
 
 
244 aa  51.6  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  26.74 
 
 
177 aa  51.6  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  29.27 
 
 
190 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  26.79 
 
 
180 aa  45.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  24.72 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1156  hypothetical protein  27.44 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149709  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  30.92 
 
 
417 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  26.8 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  26.8 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  26.8 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8191  protein of unknown function DUF308 membrane  26.01 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  25.93 
 
 
198 aa  41.2  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  20.43 
 
 
210 aa  41.2  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  24.86 
 
 
197 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>