56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00883 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  59.43 
 
 		 186 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  47.95 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  45.3 
 
 		 208 aa  141  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  47.37 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  45.66 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  46.33 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  46.86 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  42.41 
 
 		 215 aa  107  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  44.57 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  38.29 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  40.91 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  36.96 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  37.23 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  41.04 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  37.23 
 
 		 203 aa  98.2  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  39.46 
 
 		 283 aa  98.2  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  37.99 
 
 		 194 aa  97.8  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  35.59 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  39.89 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  39.89 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  36.7 
 
 		 203 aa  95.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  38.76 
 
 		 190 aa  91.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  39.56 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  39.55 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  36.57 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  32.79 
 
 		 206 aa  85.9  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  40.11 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  39.01 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  36.63 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  35.29 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  36.88 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  27.49 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  27.49 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  30 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  30.17 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  29.38 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  29.48 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  30.39 
 
 		 244 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  32.74 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  32.94 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1559  hypothetical protein  26.32 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0136598  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  28.48 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  31.01 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  31.01 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  31.01 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  29.89 
 
 		 192 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  26.11 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04730  hypothetical protein  31.29 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1316  hypothetical protein  23.7 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  27.43 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  34.09 
 
 		 417 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3859  acid-resistance membrane protein  29.14 
 
 		 189 aa  42  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  31.68 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  30.23 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>