40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1304 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  325  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1316  hypothetical protein  39.41 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2780  hypothetical protein  28.49 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2723  hypothetical protein  28.49 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  30.06 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  30.43 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  28.12 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  30.72 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  29.81 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  29.13 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0502  acid-resistance membrane protein  29.63 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0564  acid-resistance membrane protein  29.63 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0489975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1092  acid-resistance membrane protein  29.63 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  29.05 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  30.59 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  28.66 
 
 		 212 aa  52  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  31.03 
 
 		 196 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  31.19 
 
 		 219 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  31.19 
 
 		 219 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0051  hypothetical protein  29.03 
 
 		 176 aa  51.2  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  26.11 
 
 		 186 aa  50.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  28.07 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  26.03 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  29.25 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  26.51 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  25.3 
 
 		 283 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  25.43 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  25.15 
 
 		 207 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  28 
 
 		 204 aa  44.3  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  26.8 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  28.82 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  24.4 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  25.89 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  23.03 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  30.49 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2336  hypothetical protein  27.59 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  25.61 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  27.06 
 
 		 203 aa  41.6  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  27.11 
 
 		 203 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  26.51 
 
 		 203 aa  41.2  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>