57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0213 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  318  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  57.23 
 
 
208 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  52.6 
 
 
185 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  53.37 
 
 
192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  48.04 
 
 
186 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  50.28 
 
 
193 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  47.49 
 
 
186 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  47.73 
 
 
191 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  44.89 
 
 
182 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  45.25 
 
 
190 aa  140  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  50.29 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  43.02 
 
 
186 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  45.76 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  44.38 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  44.89 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  44.89 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  47.7 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  46.02 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  47.16 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  46.43 
 
 
283 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  47.37 
 
 
186 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  40.91 
 
 
186 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  46.88 
 
 
194 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  46.29 
 
 
220 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  37.99 
 
 
203 aa  104  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  41.76 
 
 
204 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  36.31 
 
 
203 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  36.31 
 
 
203 aa  99.8  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  39.57 
 
 
215 aa  97.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  38.64 
 
 
254 aa  97.8  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  41.76 
 
 
207 aa  97.1  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  37.71 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  35.23 
 
 
194 aa  95.1  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  37.21 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  33.92 
 
 
196 aa  72  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  33.54 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  29.55 
 
 
228 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  29.24 
 
 
185 aa  58.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  28.98 
 
 
177 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7759  hypothetical protein  34.01 
 
 
171 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00223773  normal  0.120642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  33.54 
 
 
417 aa  54.7  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  29.82 
 
 
180 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  31.11 
 
 
244 aa  52  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  30.41 
 
 
198 aa  50.8  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  30.97 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  34.55 
 
 
182 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  34.75 
 
 
187 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  29.75 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  27.88 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  25.75 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  28.74 
 
 
186 aa  44.7  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  27.32 
 
 
197 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  26.95 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  30.49 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04730  hypothetical protein  27.91 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  32.23 
 
 
185 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  28.07 
 
 
190 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>