44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1963 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  397  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  46.52 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  50.29 
 
 
179 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  41.18 
 
 
185 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  41.71 
 
 
186 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  42.29 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  40.7 
 
 
182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  42.51 
 
 
192 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  43.45 
 
 
190 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  41.42 
 
 
191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  38.86 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  39.18 
 
 
190 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  39.46 
 
 
208 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  39.15 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  39.15 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  42.6 
 
 
191 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  39.55 
 
 
186 aa  98.6  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  35.71 
 
 
207 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  37.87 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  41.62 
 
 
283 aa  92.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  35.16 
 
 
207 aa  92  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  35.71 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  38.24 
 
 
186 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  39.2 
 
 
220 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  34.16 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  34.85 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  37.11 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  32.78 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  31.52 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  30.07 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  33.84 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  35.03 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  31.94 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  30.61 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  30.99 
 
 
194 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  29.76 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  34.34 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  25.81 
 
 
228 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  29.85 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  29.95 
 
 
185 aa  48.9  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  30.67 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  26.09 
 
 
177 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  26.83 
 
 
180 aa  42  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04730  hypothetical protein  26.95 
 
 
177 aa  41.6  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>