32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0440 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  327  8e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  28.74 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  35.22 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  29.52 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  26.38 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  27.44 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  28.48 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  27.44 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  25.77 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  38.32 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  29.27 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  28.14 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  25.29 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  29.14 
 
 		 186 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  28.24 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  29.76 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  27.38 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  28.24 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0582  hypothetical protein  29.59 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00912525  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  26.63 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  25.45 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  24.38 
 
 		 283 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  29.14 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  26.9 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  30.95 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  26.35 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  29.22 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  42  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  29.09 
 
 		 203 aa  41.2  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  26.04 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>