56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1255 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  87.5 
 
 
208 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  76.96 
 
 
220 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  69.04 
 
 
207 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  66.01 
 
 
207 aa  242  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  40.4 
 
 
208 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  44.89 
 
 
179 aa  118  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  43.24 
 
 
186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  41.9 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  40.68 
 
 
186 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  37.93 
 
 
203 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  37.93 
 
 
203 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  36.76 
 
 
203 aa  111  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  37.36 
 
 
182 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  41.62 
 
 
215 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  40.45 
 
 
191 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  41.49 
 
 
192 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  35.75 
 
 
185 aa  98.6  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  34.9 
 
 
190 aa  98.6  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  39.77 
 
 
193 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  37.57 
 
 
190 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  39.89 
 
 
186 aa  96.3  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  40.68 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  39.15 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  37.43 
 
 
186 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  36.22 
 
 
206 aa  85.1  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  32.83 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  39.89 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  32.24 
 
 
196 aa  79  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  37.14 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  29.12 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7759  hypothetical protein  38.89 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00223773  normal  0.120642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  35.47 
 
 
254 aa  68.2  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  29.28 
 
 
183 aa  62.8  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  32.64 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  32.45 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  29.65 
 
 
244 aa  55.5  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  25.53 
 
 
228 aa  55.1  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  26.83 
 
 
180 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  26.52 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  29.89 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  28.26 
 
 
184 aa  52  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  23.16 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1165  hypothetical protein  26.29 
 
 
201 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.912906  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  31.18 
 
 
193 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  31.18 
 
 
193 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  32.74 
 
 
190 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  31.21 
 
 
193 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  31.13 
 
 
205 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  31.62 
 
 
193 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  31.19 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  29.17 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  26.21 
 
 
189 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2336  hypothetical protein  31.48 
 
 
164 aa  42  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  32.2 
 
 
417 aa  41.6  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>