66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5301 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  350  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  45 
 
 		 208 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  46.67 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  46.11 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  44.12 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  46.33 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  43.02 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  43.43 
 
 		 190 aa  131  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  47.37 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  45.29 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  43.17 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  40.33 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  41.14 
 
 		 191 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  40.68 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  40.68 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  40 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  39.04 
 
 		 203 aa  121  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  38.5 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  37.97 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  38.76 
 
 		 193 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  35.71 
 
 		 182 aa  118  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  40.33 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  39.43 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  40.57 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  35.75 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  38.86 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  39.67 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  40.34 
 
 		 220 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  35.94 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  34.44 
 
 		 204 aa  92  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  35.88 
 
 		 283 aa  85.9  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  35.03 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  28.41 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  34.44 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  29.57 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  31.18 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  28.74 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  28.81 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  35.06 
 
 		 417 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  32.17 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  26.32 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7119  hypothetical protein  36.27 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  25.54 
 
 		 228 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  28.57 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  30 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  26.86 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  25.44 
 
 		 185 aa  48.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  27.12 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  25.49 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  25.7 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  25.42 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1559  hypothetical protein  28 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0136598  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0985  putative transmembrane protein  36.99 
 
 		 102 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  24.18 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1316  hypothetical protein  22.41 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7129  integral membrane protein  34.94 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00415291  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  28.69 
 
 		 184 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6693  hypothetical protein  34.83 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0343  hypothetical protein  20.44 
 
 		 214 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  27.33 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0837  hypothetical protein  37.8 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6458  hypothetical protein  34.83 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0252294  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  19.88 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0749  hypothetical protein  27.68 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3859  acid-resistance membrane protein  26.85 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3598  hypothetical protein  28.81 
 
 		 186 aa  40.8  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>