64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7679 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  346  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  57.89 
 
 
192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  46.24 
 
 
208 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  52.6 
 
 
179 aa  147  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  42.47 
 
 
190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  47.95 
 
 
186 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  46.37 
 
 
182 aa  144  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  46.2 
 
 
186 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  45.66 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  44.12 
 
 
186 aa  131  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  42.86 
 
 
283 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  41.18 
 
 
212 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  38.04 
 
 
193 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  42.53 
 
 
190 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  40.32 
 
 
191 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  38.5 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  39.01 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  40.8 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  41.81 
 
 
194 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  39.11 
 
 
208 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  40.86 
 
 
191 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  37.16 
 
 
207 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  35.75 
 
 
219 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  35.75 
 
 
219 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  36.31 
 
 
203 aa  98.6  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  35.2 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  35.2 
 
 
203 aa  95.1  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  39.11 
 
 
220 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  33.71 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  38.98 
 
 
254 aa  85.5  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  37.43 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  37.06 
 
 
185 aa  82  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  32.98 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  38.55 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  32.63 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  35.63 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  35.98 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  32 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  26.74 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  30.06 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  33.54 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  34.39 
 
 
417 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  30.34 
 
 
244 aa  55.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  31.58 
 
 
189 aa  54.3  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  26.63 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  27.54 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  28.85 
 
 
198 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  30.41 
 
 
176 aa  52  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  27.89 
 
 
175 aa  52  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  29.7 
 
 
180 aa  51.6  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  27.49 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4412  hypothetical protein  36.14 
 
 
189 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  26.04 
 
 
192 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1156  hypothetical protein  33.12 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149709  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  28.69 
 
 
210 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  22.86 
 
 
187 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  26.47 
 
 
195 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  27.06 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  44.26 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  44.26 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  44.26 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04730  hypothetical protein  26.01 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2336  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0940  protein of unknown function DUF308 membrane  24.28 
 
 
192 aa  42  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>