58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3822 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  333  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  40.8 
 
 
185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  40.33 
 
 
186 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  38.33 
 
 
182 aa  101  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  37.87 
 
 
208 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  41.01 
 
 
186 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  39.89 
 
 
186 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  35.29 
 
 
190 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  36.57 
 
 
186 aa  87.4  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  34.32 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  35.84 
 
 
283 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  37.21 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  36.31 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  33.53 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  31.52 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  32.02 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  29.84 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  34.46 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  29.32 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  29.32 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  39.06 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  30.9 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  31.43 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  38.57 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  30.59 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  31.36 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  29.28 
 
 
219 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  29.28 
 
 
219 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  34.04 
 
 
204 aa  60.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  31.88 
 
 
215 aa  57.8  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  26.55 
 
 
196 aa  54.7  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  29.41 
 
 
194 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  28.87 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  30.94 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  24.16 
 
 
228 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  24.58 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  26.51 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  36.73 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  25.14 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  27.17 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  29.88 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  29.88 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  22.28 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  28.73 
 
 
185 aa  48.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  32.26 
 
 
193 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  27.1 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  32.26 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  32.26 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  39.51 
 
 
188 aa  45.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  30.63 
 
 
176 aa  44.7  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  27.06 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  27.68 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  28.18 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  23.95 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  29.73 
 
 
254 aa  41.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  25.43 
 
 
210 aa  41.2  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4412  hypothetical protein  29.2 
 
 
189 aa  40.8  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>