21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0679 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  33.55 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  32.45 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  32.45 
 
 
219 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  32.88 
 
 
192 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  36.51 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0440  hypothetical protein  33.12 
 
 
180 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0507632  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  29.38 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  28.85 
 
 
185 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  27.72 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  31.51 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  27.1 
 
 
183 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  28.18 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0582  hypothetical protein  47.17 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00912525  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  28.42 
 
 
186 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  28.21 
 
 
254 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  32.03 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  26.75 
 
 
182 aa  43.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  24.19 
 
 
208 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  25.93 
 
 
190 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>