71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36110 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36110  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  479  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  45.05 
 
 		 196 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  39.89 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  38.2 
 
 		 186 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  38.98 
 
 		 185 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0213  hypothetical protein  38.64 
 
 		 179 aa  99.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  34.46 
 
 		 194 aa  99.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  36.42 
 
 		 208 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3375  protein of unknown function DUF308 membrane  35.79 
 
 		 192 aa  95.1  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00523019  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  35.11 
 
 		 207 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  35.88 
 
 		 182 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3980  hypothetical protein  35.88 
 
 		 186 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  35.47 
 
 		 186 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  37.43 
 
 		 208 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  35.33 
 
 		 191 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  37.23 
 
 		 190 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  34.44 
 
 		 186 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  33.92 
 
 		 193 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36250  hypothetical protein  33.15 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  32.98 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  35.47 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  34.73 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  35.47 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1963  hypothetical protein  33.84 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.153133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  29.03 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  31.69 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  30.65 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  30.65 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5913  hypothetical protein  30.95 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.897248  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  33.71 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  34.52 
 
 		 215 aa  72  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4409  hypothetical protein  37.57 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  34.29 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3612  hypothetical protein  34.86 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.173241  hitchhiker  0.00194962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  31.58 
 
 		 184 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  29.73 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7805  hypothetical protein  29.89 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  30.32 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  29.59 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  32.75 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  31.52 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2831  protein of unknown function DUF308, membrane  32.78 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0444  hypothetical protein  30.97 
 
 		 184 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0679  hypothetical protein  28.21 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  20.3 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3584  protein of unknown function DUF308, membrane  28.57 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.339835  normal  0.0334062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  25.68 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  25.45 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0763  hypothetical protein  27.5 
 
 		 177 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  26.63 
 
 		 187 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  27.57 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  24.1 
 
 		 187 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  24.7 
 
 		 187 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1269  hypothetical protein  24.56 
 
 		 185 aa  48.9  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637458  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  31.05 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  31.05 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0332  hypothetical protein  26.32 
 
 		 177 aa  48.9  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  30.48 
 
 		 193 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  28.09 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  34.09 
 
 		 185 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  23.08 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  23.81 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04730  hypothetical protein  27.27 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0051  hypothetical protein  26.5 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  29.05 
 
 		 182 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2413  hypothetical protein  26.36 
 
 		 189 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0389455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2336  hypothetical protein  25.45 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  29.25 
 
 		 181 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1304  hypothetical protein  23.27 
 
 		 174 aa  42.4  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  30.41 
 
 		 190 aa  42  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>