56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2828 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  357  5e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  49.71 
 
 
187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  49.13 
 
 
255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  48.55 
 
 
187 aa  170  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  46.86 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  45.3 
 
 
185 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  46.51 
 
 
182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  44.44 
 
 
182 aa  144  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  36.99 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  35 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  33.72 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  34.74 
 
 
200 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  31.82 
 
 
186 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  39.29 
 
 
183 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  35.8 
 
 
185 aa  98.2  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  29.12 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  35.09 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  29.83 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  30 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  31.79 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1810  hypothetical protein  31.02 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.404127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  26.86 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  27.41 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  30.73 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  32 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  29.59 
 
 
195 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  26.86 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  27.46 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  28.48 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  28.16 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  32.09 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  27.01 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06381  hypothetical protein  27.89 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  30.52 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1597  hypothetical protein  29.33 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.585273  hitchhiker  0.00302287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  27.65 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1798  hypothetical protein  27.62 
 
 
185 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1475  hypothetical protein  27.62 
 
 
185 aa  52.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  33.85 
 
 
208 aa  51.6  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  30.17 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12131  hypothetical protein  31.25 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  35.65 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  27.6 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  30.67 
 
 
174 aa  48.5  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  26.7 
 
 
196 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  30.06 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  24.44 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  34 
 
 
175 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  33.72 
 
 
186 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  27.69 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  33.72 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  27.53 
 
 
228 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0833  hypothetical protein  22.3 
 
 
183 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  26.15 
 
 
203 aa  41.6  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0084  hypothetical protein  37.8 
 
 
175 aa  41.2  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105076  normal  0.179004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>