59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0881 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  322  2e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  33.53 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  31.69 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  29.22 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  31.28 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  31.15 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3859  acid-resistance membrane protein  33.1 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012771  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  30.66 
 
 
182 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  30.59 
 
 
196 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  30.13 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  30.77 
 
 
203 aa  60.5  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  29.8 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0833  hypothetical protein  34.29 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  30.25 
 
 
192 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1092  acid-resistance membrane protein  27.62 
 
 
189 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0502  acid-resistance membrane protein  27.62 
 
 
189 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0564  acid-resistance membrane protein  27.62 
 
 
189 aa  58.2  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0489975  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  29.75 
 
 
187 aa  57.8  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  27.32 
 
 
187 aa  57.8  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  25.14 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  30.88 
 
 
182 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06381  hypothetical protein  31.48 
 
 
196 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1798  hypothetical protein  28.21 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1475  hypothetical protein  28.21 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  28.85 
 
 
187 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  29.5 
 
 
196 aa  54.3  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0886  hypothetical protein  29.05 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.050947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  32.08 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  25.95 
 
 
185 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03312  hypothetical protein  28.4 
 
 
190 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0203  putative HdeD protein  28.4 
 
 
190 aa  52  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4870  acid-resistance membrane protein  28.4 
 
 
190 aa  52  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.756215 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3909  acid-resistance membrane protein  28.4 
 
 
190 aa  52  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0206  acid-resistance membrane protein  28.4 
 
 
190 aa  52  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03359  acid-resistance membrane protein  28.4 
 
 
190 aa  52  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.493233  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3997  acid-resistance membrane protein  28.4 
 
 
190 aa  52  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3713  acid-resistance membrane protein  28.4 
 
 
190 aa  52  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00199236  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3813  acid-resistance membrane protein  28.4 
 
 
181 aa  52  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  32.67 
 
 
190 aa  52  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  51.2  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  25.7 
 
 
184 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  26.03 
 
 
191 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  25.29 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  29.81 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  34.52 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  41 
 
 
210 aa  48.5  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  28.93 
 
 
195 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0585  protein of unknown function DUF308 membrane  33.33 
 
 
228 aa  47.8  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  36.47 
 
 
208 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  29.38 
 
 
187 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  27.57 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  29.76 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  30.63 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  29.75 
 
 
196 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  23.84 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1046  permease  35.23 
 
 
171 aa  42  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0496697  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  32.58 
 
 
202 aa  41.2  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4326  hypothetical protein  28.9 
 
 
197 aa  40.8  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>