34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3337 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  347  6e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  35.06 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  30.27 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  28.33 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  30.39 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  32.08 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  29.73 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  29.57 
 
 		 255 aa  67.8  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  30.27 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  34.92 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  30.46 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  31.25 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  30.36 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  29.76 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  29.71 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  32.61 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  35.33 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  29.85 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  30.32 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  30.18 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0833  hypothetical protein  31.25 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  29.59 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  29.23 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  32.34 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  33.11 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  29.9 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  31.55 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  28.74 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  38.82 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  31.19 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3835  hypothetical protein  29.14 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1810  hypothetical protein  29.79 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.404127 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  26.34 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  31.87 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>