79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3207 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  390  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  53.12 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  51.67 
 
 		 190 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  48.95 
 
 		 192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  44.62 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  47.59 
 
 		 191 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  50.29 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  31.68 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  34 
 
 		 196 aa  93.2  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  36.16 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4326  hypothetical protein  36.76 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  36.05 
 
 		 185 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  34.88 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  32.12 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  31.95 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  33.71 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  32.94 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  29.55 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  33.52 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  29.13 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  29.89 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  28.9 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  32.88 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  29.55 
 
 		 186 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  32.18 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  30.86 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  26.7 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  25.73 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06381  hypothetical protein  32.14 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  28.57 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3813  acid-resistance membrane protein  30.81 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0206  acid-resistance membrane protein  30.81 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0203  putative HdeD protein  30.81 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3909  acid-resistance membrane protein  30.81 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1475  hypothetical protein  27.65 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4870  acid-resistance membrane protein  30.81 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.756215 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03312  hypothetical protein  30.81 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1798  hypothetical protein  27.65 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03359  acid-resistance membrane protein  30.81 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.493233  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3997  acid-resistance membrane protein  30.81 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3713  acid-resistance membrane protein  30.81 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00199236  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1092  acid-resistance membrane protein  28.66 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0564  acid-resistance membrane protein  28.66 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0489975  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  27.5 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0502  acid-resistance membrane protein  28.66 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  29.94 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  28.82 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  28.98 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3859  acid-resistance membrane protein  29.61 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  36.13 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  28.82 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1416  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.336817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1255  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.390712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  30.96 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  32.2 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  26.54 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  38.1 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  37.4 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4217  HdeD protein  30.16 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0641  hypothetical protein  28 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  30.15 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  25.84 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3094  protein of unknown function DUF308, membrane  32.1 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.170004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3035  protein of unknown function DUF308, membrane  32.1 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3051  protein of unknown function DUF308, membrane  32.1 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  26.76 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  24.39 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  28.75 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  25.82 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  26.81 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  25.82 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 437 aa  42.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0833  hypothetical protein  25 
 
 		 183 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4145  membrane-bound protease  27.27 
 
 		 452 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  33.12 
 
 		 244 aa  41.2  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3118  hypothetical protein  31.4 
 
 		 179 aa  41.2  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.338177 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>