30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3813 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3813  acid-resistance membrane protein  100 
 
 		 181 aa  351  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0203  putative HdeD protein  98.9 
 
 		 190 aa  349  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03312  hypothetical protein  98.9 
 
 		 190 aa  349  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4870  acid-resistance membrane protein  98.9 
 
 		 190 aa  349  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.756215 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3909  acid-resistance membrane protein  98.9 
 
 		 190 aa  349  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0206  acid-resistance membrane protein  98.9 
 
 		 190 aa  349  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03359  acid-resistance membrane protein  98.9 
 
 		 190 aa  349  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.493233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3713  acid-resistance membrane protein  98.9 
 
 		 190 aa  349  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00199236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3997  acid-resistance membrane protein  98.9 
 
 		 190 aa  349  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0564  acid-resistance membrane protein  45.81 
 
 		 189 aa  167  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0489975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1092  acid-resistance membrane protein  45.81 
 
 		 189 aa  167  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0502  acid-resistance membrane protein  45.81 
 
 		 189 aa  167  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3859  acid-resistance membrane protein  49.72 
 
 		 189 aa  160  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  31.25 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  29.94 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  28.07 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  29.61 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  30.23 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  28.4 
 
 		 176 aa  52  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  29.24 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  26.79 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  26.47 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  24.85 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  26.74 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  24.05 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1475  hypothetical protein  31.13 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1798  hypothetical protein  31.13 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  30.77 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  27.27 
 
 		 203 aa  42  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0746  hypothetical protein  26.45 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0392117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>