26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0833 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0833  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  349  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1798  hypothetical protein  24.59 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1475  hypothetical protein  24.59 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  29.19 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  29.94 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  25.79 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  28.99 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  32.26 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  29.53 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  24.06 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  34.62 
 
 		 188 aa  51.2  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06381  hypothetical protein  28.09 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  24.48 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  26 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  23.42 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  22.36 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  25.95 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  26.47 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  26.49 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  26.99 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  22.01 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  25.33 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  25 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  23.96 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  41.2  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  29.41 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.484223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>