62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1099 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  352  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  38.55 
 
 
186 aa  124  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  40.12 
 
 
187 aa  108  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  36.41 
 
 
192 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  35.87 
 
 
190 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  38.56 
 
 
191 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  33.15 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  36.05 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  32.74 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  32.6 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  29.67 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  32.07 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  33.53 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06381  hypothetical protein  31.15 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  30.41 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  30.95 
 
 
255 aa  72  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  28.11 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  27.78 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  26.11 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  28.33 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  31.35 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  31.79 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  27.17 
 
 
181 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  31.52 
 
 
203 aa  60.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  34.01 
 
 
208 aa  58.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1597  hypothetical protein  29.41 
 
 
167 aa  57.8  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.585273  hitchhiker  0.00302287 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  27.42 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  27.46 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  30.23 
 
 
174 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  30.23 
 
 
174 aa  54.7  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  30.22 
 
 
182 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12131  hypothetical protein  31.62 
 
 
169 aa  54.3  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0833  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  36.9 
 
 
188 aa  52  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  22.75 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1475  hypothetical protein  25.29 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1798  hypothetical protein  25.29 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0564  acid-resistance membrane protein  24.86 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0489975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1092  acid-resistance membrane protein  24.86 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0502  acid-resistance membrane protein  24.86 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  24.29 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  28.3 
 
 
191 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  40.23 
 
 
206 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4870  acid-resistance membrane protein  24.85 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.756215 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03312  hypothetical protein  24.85 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3713  acid-resistance membrane protein  24.85 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00199236  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3909  acid-resistance membrane protein  24.85 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3813  acid-resistance membrane protein  24.85 
 
 
181 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0206  acid-resistance membrane protein  24.85 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3997  acid-resistance membrane protein  24.85 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03359  acid-resistance membrane protein  24.85 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.493233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0203  putative HdeD protein  24.85 
 
 
190 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  24.06 
 
 
185 aa  44.7  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  31.01 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  27.62 
 
 
200 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  32.56 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  30.58 
 
 
196 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  29.31 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6893  hypothetical protein  29.77 
 
 
191 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  32.76 
 
 
208 aa  40.8  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>