60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3372 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  357  7e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  52.43 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  31.61 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  28.48 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  29.48 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  29.61 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  27.32 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  29.05 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  26.78 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  28.41 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  28.07 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  26.86 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  26.34 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  27.12 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  28.16 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  24.04 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  24.72 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  26.86 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  23.46 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  28.25 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  26.98 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  26.6 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  27.65 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  21.74 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  24.73 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  26.67 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  26.63 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  26.49 
 
 		 200 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  25.41 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0502  acid-resistance membrane protein  22.58 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1092  acid-resistance membrane protein  22.58 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0564  acid-resistance membrane protein  22.58 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0489975  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  25.27 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1597  hypothetical protein  31.3 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.585273  hitchhiker  0.00302287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3713  acid-resistance membrane protein  26.79 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00199236  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03312  hypothetical protein  26.79 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1798  hypothetical protein  26.88 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0203  putative HdeD protein  26.79 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03359  acid-resistance membrane protein  26.79 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.493233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4870  acid-resistance membrane protein  26.79 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.756215 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1475  hypothetical protein  26.88 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3822  hypothetical protein  22.28 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3909  acid-resistance membrane protein  26.79 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3813  acid-resistance membrane protein  26.79 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0206  acid-resistance membrane protein  26.79 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3997  acid-resistance membrane protein  26.79 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  26.52 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4326  hypothetical protein  29.31 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  25.32 
 
 		 192 aa  47.8  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  29.76 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  29.76 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  23.04 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1163  hypothetical protein  23.04 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  24.06 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0620  hypothetical protein  22.51 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.286873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  21.34 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  23.73 
 
 		 196 aa  42  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06381  hypothetical protein  26.32 
 
 		 196 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3859  acid-resistance membrane protein  25.49 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>