45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1061 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  99.47 
 
 
255 aa  357  6e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  354  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  90.37 
 
 
187 aa  328  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  59.89 
 
 
182 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  59.65 
 
 
182 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  59.3 
 
 
182 aa  185  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  49.71 
 
 
190 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  49.42 
 
 
185 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  38.46 
 
 
187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  39.23 
 
 
187 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  38.3 
 
 
196 aa  127  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  42.7 
 
 
200 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1810  hypothetical protein  40.24 
 
 
198 aa  94.4  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.404127 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  37.27 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  35.5 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  29.57 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  29.51 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  32.69 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  29.89 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  30.41 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  29.05 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  26.82 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  31.15 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  30.68 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  28.95 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  31.79 
 
 
191 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  27.62 
 
 
185 aa  61.6  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  26.29 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  28.8 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  28.89 
 
 
203 aa  58.9  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  27.69 
 
 
196 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1255  hypothetical protein  27.37 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  27.32 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  34.3 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  28.27 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  30.23 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  22.73 
 
 
192 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  31.21 
 
 
202 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  27.97 
 
 
210 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  30.14 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1475  hypothetical protein  27.5 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1798  hypothetical protein  27.5 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  28.18 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  30.57 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4326  hypothetical protein  24.55 
 
 
197 aa  42  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>